More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1750 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
463 aa  932    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  46.75 
 
 
463 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 
462 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 
477 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 
473 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 
458 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.94 
 
 
475 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  43.2 
 
 
470 aa  355  6.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
467 aa  352  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  45.89 
 
 
446 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  47.08 
 
 
431 aa  343  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
468 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
468 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
468 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 
450 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 
445 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
467 aa  334  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
468 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 
449 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 
456 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  42.3 
 
 
462 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.65 
 
 
456 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  41.63 
 
 
463 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 
450 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  39.41 
 
 
482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  38.99 
 
 
482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
480 aa  326  5e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  43.24 
 
 
455 aa  326  7e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  38.78 
 
 
482 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  38.95 
 
 
480 aa  324  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  39.24 
 
 
482 aa  325  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  38.78 
 
 
482 aa  323  4e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  43.26 
 
 
466 aa  323  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 
467 aa  323  5e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
469 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  42.64 
 
 
459 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  37.5 
 
 
491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
465 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  37.29 
 
 
491 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  38.77 
 
 
475 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  37.53 
 
 
491 aa  318  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 
461 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
465 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
462 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 
467 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  41.63 
 
 
443 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  40.53 
 
 
443 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 
480 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  37.34 
 
 
468 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.59 
 
 
469 aa  273  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 
458 aa  270  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
471 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
455 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
461 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  36.97 
 
 
464 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  36.97 
 
 
464 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  36.97 
 
 
464 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  36.97 
 
 
464 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  36.97 
 
 
464 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
486 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  36.91 
 
 
464 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  36.97 
 
 
715 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  37.28 
 
 
472 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
481 aa  260  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  35.53 
 
 
464 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  34.57 
 
 
486 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
472 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
472 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
472 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  34.83 
 
 
454 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
477 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  37.31 
 
 
465 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
477 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.5 
 
 
468 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  33.11 
 
 
446 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
487 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  36.84 
 
 
472 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
465 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.19 
 
 
454 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
474 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  33.83 
 
 
454 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  34.27 
 
 
483 aa  246  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  35.26 
 
 
463 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
460 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  35.28 
 
 
484 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  39.51 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 
472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
476 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  35.28 
 
 
484 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  35.28 
 
 
476 aa  244  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
469 aa  243  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
474 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
474 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>