More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1498 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  100 
 
 
459 aa  929    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  55.6 
 
 
468 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  54 
 
 
458 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  54.93 
 
 
468 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  54.93 
 
 
468 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  54.93 
 
 
468 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  53.56 
 
 
469 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.64 
 
 
463 aa  338  8e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 
450 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  43.79 
 
 
431 aa  326  7e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
450 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 
449 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  41.59 
 
 
443 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  41.63 
 
 
443 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  40.31 
 
 
463 aa  310  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.23 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
461 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
465 aa  296  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  38.51 
 
 
463 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
467 aa  290  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 
475 aa  286  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  36.24 
 
 
470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.43 
 
 
466 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
467 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  37.53 
 
 
455 aa  282  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  37.74 
 
 
462 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
467 aa  281  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 
461 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
473 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
477 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
465 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
480 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
480 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 
456 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 
456 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
467 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
480 aa  260  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  40.85 
 
 
482 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  41.07 
 
 
480 aa  258  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  32.35 
 
 
491 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  32.35 
 
 
491 aa  256  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  32.1 
 
 
468 aa  256  6e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
465 aa  255  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  40.75 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  40.75 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  40.75 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  40.44 
 
 
482 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  32.36 
 
 
491 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  40.57 
 
 
475 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
472 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  35.16 
 
 
481 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
481 aa  243  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.87 
 
 
468 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
487 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 
455 aa  239  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
461 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
462 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
469 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
471 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  35.65 
 
 
465 aa  236  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  34.28 
 
 
464 aa  236  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
469 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
469 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
468 aa  233  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
486 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  33.55 
 
 
473 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
474 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
474 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
471 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
469 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
481 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
471 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  38.1 
 
 
454 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  38.1 
 
 
454 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
474 aa  229  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2216  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
457 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 
447 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  33.99 
 
 
464 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  33.99 
 
 
464 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  33.99 
 
 
464 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 
477 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  33.99 
 
 
464 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  33.99 
 
 
464 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  33.99 
 
 
464 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.77 
 
 
493 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
477 aa  227  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  31.66 
 
 
446 aa  227  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 
493 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  33.99 
 
 
715 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  41.2 
 
 
486 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.79 
 
 
454 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  32.69 
 
 
484 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
477 aa  222  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.73 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>