More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1752 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
469 aa  942    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  63.81 
 
 
467 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 
480 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
480 aa  317  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  41.47 
 
 
465 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
464 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 
472 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
474 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  38.91 
 
 
462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  42 
 
 
463 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  39.17 
 
 
462 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  41.15 
 
 
463 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
469 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
469 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
493 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  37.91 
 
 
486 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
493 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
466 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
481 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
487 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  38.79 
 
 
466 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
474 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
471 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
486 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
468 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0203  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
462 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
474 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
474 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.32 
 
 
468 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
486 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
486 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
486 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
474 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
471 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
471 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  35.78 
 
 
464 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1380  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  38.86 
 
 
461 aa  256  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
476 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  35.42 
 
 
476 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.15 
 
 
471 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  33.19 
 
 
491 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 
481 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
465 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  33.12 
 
 
491 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  36.13 
 
 
463 aa  246  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  44.21 
 
 
491 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  34.49 
 
 
464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  33.84 
 
 
464 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  33.84 
 
 
464 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  33.84 
 
 
464 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  33.84 
 
 
464 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  33.84 
 
 
464 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
463 aa  243  6e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  33.84 
 
 
715 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  45.68 
 
 
482 aa  239  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.01 
 
 
480 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  46.01 
 
 
480 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  34.57 
 
 
484 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  34.57 
 
 
484 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  34.63 
 
 
483 aa  237  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 
477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
467 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  45.63 
 
 
482 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  45.63 
 
 
482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  45.63 
 
 
482 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
477 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
468 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
468 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
468 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  45.25 
 
 
482 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  45.25 
 
 
475 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1170  heavy metal sensor kinase family protein  33.12 
 
 
454 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1205  heavy metal sensor kinase subfamily  33.12 
 
 
454 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1054  heavy metal sensor kinase subfamily  33.12 
 
 
454 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
458 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
462 aa  231  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
461 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  43.94 
 
 
470 aa  230  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1190  heavy metal sensor kinase subfamily  33.12 
 
 
454 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  36.36 
 
 
436 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
468 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  32.91 
 
 
454 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.433807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
489 aa  226  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  32.48 
 
 
463 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
461 aa  226  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1217  heavy metal sensor histidine kinase  33.12 
 
 
452 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00057319  normal  0.58155 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2069  heavy metal sensor histidine kinase  33.12 
 
 
452 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260853  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0915  heavy metal sensor histidine kinase  33.12 
 
 
452 aa  224  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000246705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01883  predicted sensory kinase in two-component regulatory system with YedW  32.19 
 
 
452 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000273191  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01873  hypothetical protein  32.19 
 
 
452 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000189435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  33.76 
 
 
459 aa  223  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2199  heavy metal sensor histidine kinase  32.91 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1677  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00542699  normal  0.137628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.48 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
462 aa  220  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.82 
 
 
462 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>