More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1126 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  74.45 
 
 		 465 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  92.51 
 
 		 454 aa  852    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  100 
 
 		 454 aa  920    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  77.92 
 
 		 454 aa  713    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  73.01 
 
 		 470 aa  666    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  53.14 
 
 		 481 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  52.46 
 
 		 473 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.37 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 		 485 aa  345  8e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 		 479 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2068  heavy metal sensor signal transduction histidine Kinases (STHK)  44.67 
 
 		 484 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 494 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 494 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 482 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 494 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 482 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5872  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 		 485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2481  heavy metal sensor histidine kinase  41.11 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000221939  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2193  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2085  heavy metal sensor histidine kinase  40.67 
 
 		 461 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000557758  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6518  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 		 484 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 462 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 463 aa  246  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  38.8 
 
 		 480 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  38.8 
 
 		 482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  38.8 
 
 		 482 aa  244  3e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  38.8 
 
 		 482 aa  244  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3560  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0861327  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1092  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.92 
 
 		 464 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  38.52 
 
 		 482 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  41.41 
 
 		 482 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  38.23 
 
 		 475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2389  heavy metal sensor kinase  43.63 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0021647  normal  0.121803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2102  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.63 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  34.5 
 
 		 463 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2216  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.34 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  38.48 
 
 		 459 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 477 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 		 473 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1712  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 462 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.59 
 
 		 446 aa  226  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1630  putative two-component sensor  37.34 
 
 		 453 aa  226  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 475 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.51 
 
 		 458 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 480 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  38.14 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 		 450 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 461 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  36.08 
 
 		 463 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 		 449 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  41.64 
 
 		 470 aa  217  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 		 486 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 462 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 469 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 469 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 469 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 461 aa  216  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 461 aa  216  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  41.84 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  33.41 
 
 		 443 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 465 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.26 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 468 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 468 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 468 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 465 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 469 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  43.46 
 
 		 486 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 460 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  40.85 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 467 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  36 
 
 		 491 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 471 aa  206  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  36 
 
 		 491 aa  206  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 474 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  37.5 
 
 		 468 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 		 456 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 467 aa  204  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 447 aa  204  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  33.82 
 
 		 483 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  35.69 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.33 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 458 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  33.33 
 
 		 466 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  29.74 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  41.89 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>