More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3856 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  100 
 
 
446 aa  895    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  66.37 
 
 
450 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  64.62 
 
 
449 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  64.82 
 
 
450 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  65.11 
 
 
445 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  59.47 
 
 
431 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  57.78 
 
 
443 aa  485  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  58.31 
 
 
443 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.27 
 
 
458 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 
468 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 
468 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 
468 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 
463 aa  344  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
469 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  44.32 
 
 
463 aa  336  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 
465 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 
461 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
465 aa  329  8e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
465 aa  329  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
461 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  42.67 
 
 
462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.6 
 
 
462 aa  326  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
456 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
465 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  42.14 
 
 
466 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  40.35 
 
 
463 aa  316  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 
467 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
456 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
467 aa  310  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.59 
 
 
475 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 
467 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  40.39 
 
 
470 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
467 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  41.36 
 
 
459 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  39.43 
 
 
455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.04 
 
 
455 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 
473 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
461 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
462 aa  268  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  42.86 
 
 
480 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.56 
 
 
480 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  42.18 
 
 
482 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  42.18 
 
 
482 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  35.21 
 
 
491 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  42.18 
 
 
482 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  35.01 
 
 
491 aa  259  9e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  35.36 
 
 
491 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  42.14 
 
 
482 aa  259  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  41.89 
 
 
482 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  32.81 
 
 
446 aa  257  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
477 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
480 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  41.87 
 
 
475 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  34.64 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  37.97 
 
 
473 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
447 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 
493 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
481 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 
493 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  36.92 
 
 
481 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  34.11 
 
 
484 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  33.9 
 
 
484 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 
465 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 
486 aa  235  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  42.05 
 
 
486 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  37.04 
 
 
436 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  35.73 
 
 
465 aa  230  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
470 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  33.33 
 
 
483 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  41.4 
 
 
463 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
458 aa  229  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.59 
 
 
454 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
486 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
486 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
458 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  41.4 
 
 
463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  40.57 
 
 
454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  41.59 
 
 
454 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  45.35 
 
 
472 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  32.46 
 
 
464 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.97 
 
 
468 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  32.25 
 
 
464 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  32.25 
 
 
464 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  32.25 
 
 
464 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  32.25 
 
 
464 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  32.25 
 
 
464 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
477 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
471 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.88 
 
 
460 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  44.98 
 
 
471 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  44.29 
 
 
463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 
472 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 
472 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 
472 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  32.39 
 
 
715 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  44.01 
 
 
472 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  44.48 
 
 
469 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>