More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0587 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  97.08 
 
 		 482 aa  941    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  98.33 
 
 		 480 aa  972    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  97.7 
 
 		 482 aa  947    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  97.29 
 
 		 482 aa  943    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  97.08 
 
 		 482 aa  940    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  97.91 
 
 		 482 aa  949    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  97.26 
 
 		 475 aa  935    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  100 
 
 		 480 aa  986    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  56.88 
 
 		 491 aa  545  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  56.04 
 
 		 491 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  56.18 
 
 		 491 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.51 
 
 		 473 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  42.92 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 477 aa  355  8.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  37.61 
 
 		 468 aa  327  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 463 aa  326  7e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 462 aa  299  8e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  36.63 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 456 aa  290  4e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 461 aa  289  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  36.23 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.91 
 
 		 466 aa  286  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 465 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 456 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 461 aa  276  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 467 aa  274  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 450 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35.07 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 465 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 		 468 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 475 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  33.54 
 
 		 431 aa  264  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 449 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 450 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 461 aa  262  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 445 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.86 
 
 		 446 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 467 aa  260  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  41.07 
 
 		 459 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  34.75 
 
 		 455 aa  257  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 467 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  41.64 
 
 		 443 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  38.8 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  40.73 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 486 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 469 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  40.25 
 
 		 454 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  33.75 
 
 		 467 aa  236  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 493 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44 
 
 		 486 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 486 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.96 
 
 		 486 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.56 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 472 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.79 
 
 		 469 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  42.24 
 
 		 486 aa  229  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 472 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.31 
 
 		 471 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 466 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  31.43 
 
 		 464 aa  223  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  38.61 
 
 		 483 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  38.92 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  38.92 
 
 		 484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  38.92 
 
 		 484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 474 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  45.77 
 
 		 462 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 458 aa  217  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 471 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  37.73 
 
 		 481 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 469 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  43.23 
 
 		 465 aa  216  7e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 471 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  38.59 
 
 		 466 aa  216  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 469 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  29.85 
 
 		 446 aa  216  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 469 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  45.17 
 
 		 462 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 489 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 471 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1380  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  45.65 
 
 		 461 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>