More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3625 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  100 
 
 
469 aa  947    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  52.58 
 
 
477 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  53.78 
 
 
460 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  52.05 
 
 
463 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  54.76 
 
 
460 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  54.76 
 
 
460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  48.81 
 
 
472 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  51.4 
 
 
463 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  48.6 
 
 
472 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  48.6 
 
 
472 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  48.6 
 
 
472 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  45.42 
 
 
471 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  45.18 
 
 
472 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
458 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
463 aa  273  7e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
471 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
481 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.02 
 
 
468 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  35.21 
 
 
464 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  35.21 
 
 
464 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  35.21 
 
 
464 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  35.21 
 
 
464 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  35.21 
 
 
464 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  35.21 
 
 
464 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
477 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  35.21 
 
 
715 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
480 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  35.57 
 
 
463 aa  259  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
462 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
480 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  34.41 
 
 
483 aa  256  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  35.06 
 
 
464 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  34.62 
 
 
484 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  35.27 
 
 
465 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.38 
 
 
461 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  34.41 
 
 
484 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
474 aa  250  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
461 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
474 aa  247  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.63 
 
 
467 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
481 aa  247  4e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  38.08 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  36.67 
 
 
462 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
467 aa  243  7e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  36.74 
 
 
467 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
465 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
467 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
464 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  40.94 
 
 
463 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
475 aa  237  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
476 aa  236  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  32.05 
 
 
476 aa  236  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
462 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
472 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
486 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  40.6 
 
 
466 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 
468 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
474 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
474 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
477 aa  230  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.09 
 
 
471 aa  230  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 
465 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 
465 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  38.4 
 
 
470 aa  229  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
474 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
480 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  40.79 
 
 
480 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
471 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
458 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  34.24 
 
 
475 aa  227  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 
456 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  41.09 
 
 
482 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
455 aa  226  9e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  41.19 
 
 
482 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 
445 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  41.19 
 
 
482 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  41.19 
 
 
482 aa  225  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
469 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
469 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
471 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.49 
 
 
465 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  36.11 
 
 
486 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
469 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  33.98 
 
 
431 aa  223  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 
467 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  40.88 
 
 
475 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  40.88 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3530  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
484 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
449 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
493 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
493 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
486 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
450 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
450 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  44.48 
 
 
446 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
456 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
466 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>