More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5987 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  83.19 
 
 		 486 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  82.05 
 
 		 486 aa  708    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  98.78 
 
 		 493 aa  957    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  83.19 
 
 		 486 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 493 aa  971    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  58.7 
 
 		 486 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  54.66 
 
 		 487 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  56.45 
 
 		 486 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.04 
 
 		 480 aa  296  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  40.53 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 		 464 aa  280  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  40.16 
 
 		 466 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  40.32 
 
 		 467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 469 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 469 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 469 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0203  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.21 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 469 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 474 aa  261  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1380  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  39.63 
 
 		 461 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 481 aa  252  9.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 		 471 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 467 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 467 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 		 465 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  41.76 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 450 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.59 
 
 		 449 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.12 
 
 		 446 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  44.51 
 
 		 431 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  39.05 
 
 		 463 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  36.29 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  43.41 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  40.92 
 
 		 491 aa  237  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  37.27 
 
 		 462 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.82 
 
 		 476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  42.82 
 
 		 476 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 477 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  40.8 
 
 		 491 aa  236  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  37.27 
 
 		 462 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  40.8 
 
 		 491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 		 480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  39.32 
 
 		 480 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  43.04 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 482 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 477 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  42.81 
 
 		 463 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 489 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  38.7 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  38.39 
 
 		 482 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  38.7 
 
 		 482 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  38.7 
 
 		 482 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  39.26 
 
 		 466 aa  230  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 473 aa  230  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  40 
 
 		 455 aa  229  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  41.61 
 
 		 443 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  38.39 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  43.77 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 		 489 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  33.6 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.33 
 
 		 468 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 447 aa  228  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  41.03 
 
 		 463 aa  227  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  38.75 
 
 		 475 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  36.9 
 
 		 462 aa  226  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 458 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.2 
 
 		 471 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 		 481 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 456 aa  223  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 460 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.27 
 
 		 469 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 460 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  35.28 
 
 		 468 aa  219  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 469 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.75 
 
 		 468 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  33.54 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  33.54 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  33.54 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  33.54 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  33.54 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.88 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>