More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0654 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  100 
 
 		 466 aa  927    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  78.38 
 
 		 465 aa  721    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  78.96 
 
 		 465 aa  715    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  78.38 
 
 		 465 aa  721    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  69.3 
 
 		 456 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  69.08 
 
 		 456 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  63.16 
 
 		 465 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  60 
 
 		 463 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  59.65 
 
 		 462 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  60 
 
 		 461 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  50.11 
 
 		 467 aa  415  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 		 461 aa  411  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 		 467 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  44.4 
 
 		 463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  43.26 
 
 		 463 aa  323  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 		 450 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 449 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.14 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 		 455 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 467 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  41.18 
 
 		 431 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 468 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  35.98 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  36.57 
 
 		 482 aa  294  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  36.57 
 
 		 482 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  36.36 
 
 		 482 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  36.36 
 
 		 482 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  36.61 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  35.95 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 		 475 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  39.83 
 
 		 443 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 480 aa  282  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  40.22 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  35.91 
 
 		 480 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  38.39 
 
 		 470 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.83 
 
 		 477 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  38.43 
 
 		 459 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  34.77 
 
 		 468 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  38.51 
 
 		 455 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 473 aa  262  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 462 aa  257  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  33.4 
 
 		 491 aa  256  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  32.58 
 
 		 491 aa  256  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 461 aa  256  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  32.58 
 
 		 491 aa  256  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 466 aa  249  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  41.37 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.37 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  34.3 
 
 		 465 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 480 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.41 
 
 		 472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 477 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  44.06 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 		 460 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 493 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.6 
 
 		 469 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 493 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 486 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 487 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  37.98 
 
 		 486 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 477 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  41.53 
 
 		 463 aa  223  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 463 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  35.4 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  41.86 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 482 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 482 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 		 458 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  38.51 
 
 		 471 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  37.36 
 
 		 472 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  31.73 
 
 		 476 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  30.42 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 469 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 469 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 494 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 474 aa  217  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.4 
 
 		 464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 469 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 		 481 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.22 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 494 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>