More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001640 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
461 aa  953    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  41.8 
 
 
446 aa  344  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
465 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
465 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.3 
 
 
446 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  34.63 
 
 
470 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  35.64 
 
 
463 aa  265  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
477 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
462 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
473 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
463 aa  263  4e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
465 aa  262  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  34.14 
 
 
462 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 
461 aa  259  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  32.52 
 
 
463 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  32.98 
 
 
482 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
456 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
465 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.12 
 
 
466 aa  256  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  32.98 
 
 
482 aa  256  7e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  33.63 
 
 
431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  32.42 
 
 
482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  32.7 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  32.77 
 
 
482 aa  253  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
445 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
480 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  32.39 
 
 
468 aa  252  1e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  32.36 
 
 
482 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
455 aa  250  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
462 aa  249  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
450 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
461 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
467 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  32.42 
 
 
475 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
467 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  32.01 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  32.17 
 
 
443 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
468 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  37.43 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
475 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
468 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
468 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
468 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
469 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
458 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
472 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 
467 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  31.72 
 
 
491 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  31.09 
 
 
491 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  31.71 
 
 
491 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
467 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  38.1 
 
 
455 aa  220  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
469 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
469 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
464 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
493 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
480 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
469 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  37.63 
 
 
454 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
471 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
471 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  30.82 
 
 
465 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
486 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
486 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3530  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
484 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
477 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
474 aa  206  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
487 aa  206  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
486 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  36.24 
 
 
454 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  39.19 
 
 
462 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
470 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  36.54 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  36.52 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
480 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.34 
 
 
469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3464  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  38.85 
 
 
462 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
472 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  37.5 
 
 
472 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  37.23 
 
 
473 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
476 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  38.18 
 
 
476 aa  199  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.24 
 
 
454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  36.65 
 
 
472 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38 
 
 
468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  32.7 
 
 
466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  38.27 
 
 
463 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  38.28 
 
 
463 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  37.41 
 
 
460 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
471 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>