More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_45870 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  94.29 
 
 		 473 aa  897    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  100 
 
 		 481 aa  964    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  52.9 
 
 		 454 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  53.14 
 
 		 454 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  51.57 
 
 		 454 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  51.96 
 
 		 465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  49.58 
 
 		 470 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  48.23 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.01 
 
 		 482 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 482 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 		 494 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 494 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2068  heavy metal sensor signal transduction histidine Kinases (STHK)  45.76 
 
 		 484 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 		 479 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 494 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5872  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 485 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6518  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.02 
 
 		 484 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2193  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 		 461 aa  315  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2481  heavy metal sensor histidine kinase  42.38 
 
 		 461 aa  315  8e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000221939  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2085  heavy metal sensor histidine kinase  41.94 
 
 		 461 aa  312  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000557758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  37.26 
 
 		 431 aa  246  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  48.31 
 
 		 475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 463 aa  242  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  37.07 
 
 		 459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3560  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 		 444 aa  240  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0861327  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.92 
 
 		 446 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 472 aa  238  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  42.99 
 
 		 443 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 458 aa  236  9e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 469 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  35.35 
 
 		 443 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 469 aa  233  9e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.89 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2389  heavy metal sensor kinase  46.64 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0021647  normal  0.121803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 468 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 468 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2102  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 		 445 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 468 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1092  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 		 464 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2216  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1630  putative two-component sensor  46.45 
 
 		 453 aa  226  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 		 480 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.89 
 
 		 467 aa  225  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 480 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  35.99 
 
 		 466 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 486 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 469 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 467 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 468 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 471 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 476 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  34.37 
 
 		 476 aa  219  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 460 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  37.13 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  37.13 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  38.07 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  36.84 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  37.73 
 
 		 480 aa  217  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 450 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 473 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 480 aa  216  8e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 474 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  36.84 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1712  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  33.41 
 
 		 463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  37.4 
 
 		 470 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 481 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.6 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.69 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  41.11 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  36.81 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.61 
 
 		 469 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  33.69 
 
 		 486 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  39.54 
 
 		 462 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  29.57 
 
 		 463 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  42.24 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 465 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 465 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 465 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 472 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 472 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 		 466 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 472 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.03 
 
 		 468 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 477 aa  206  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  39.63 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  39.63 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  39.63 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 477 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>