More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3228 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  82.86 
 
 		 485 aa  808    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 494 aa  1002    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  85.83 
 
 		 479 aa  860    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  98.58 
 
 		 494 aa  985    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  87.45 
 
 		 482 aa  865    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  98.38 
 
 		 494 aa  983    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  87.25 
 
 		 482 aa  860    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2068  heavy metal sensor signal transduction histidine Kinases (STHK)  54.73 
 
 		 484 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5872  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  55 
 
 		 485 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6518  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  57.91 
 
 		 484 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  45.59 
 
 		 473 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  45.8 
 
 		 481 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 		 458 aa  360  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.17 
 
 		 454 aa  339  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  42.3 
 
 		 454 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  42.98 
 
 		 454 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.39 
 
 		 465 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2193  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 		 461 aa  289  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2481  heavy metal sensor histidine kinase  38.91 
 
 		 461 aa  289  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000221939  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2085  heavy metal sensor histidine kinase  38.7 
 
 		 461 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000557758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3560  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 444 aa  236  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0861327  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.26 
 
 		 466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1092  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 464 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 475 aa  213  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 467 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 472 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1712  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 462 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 467 aa  210  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 462 aa  210  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 463 aa  210  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 469 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 469 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 480 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 469 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1630  putative two-component sensor  41.45 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  32.55 
 
 		 463 aa  202  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 469 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2389  heavy metal sensor kinase  42.57 
 
 		 445 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0021647  normal  0.121803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2102  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 445 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 474 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2216  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 457 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 468 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 489 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 468 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 468 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 480 aa  200  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  33.19 
 
 		 467 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1074  Signal transduction histidine kinase  71.03 
 
 		 273 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.125502  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  31.41 
 
 		 463 aa  199  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  33 
 
 		 470 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2304  two-component sensor  71.03 
 
 		 280 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 469 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  36.54 
 
 		 482 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 450 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 466 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 450 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 471 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 480 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  37.01 
 
 		 480 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 467 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  39.79 
 
 		 466 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 449 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.73 
 
 		 471 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 461 aa  193  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  34.35 
 
 		 459 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  30.09 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  33.23 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.22 
 
 		 468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 465 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 458 aa  191  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  33.19 
 
 		 431 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  36.04 
 
 		 482 aa  189  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 445 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  36.04 
 
 		 482 aa  189  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  36.04 
 
 		 482 aa  189  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  36.04 
 
 		 475 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  36.04 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  35.84 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  36.18 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  36.18 
 
 		 491 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  33.33 
 
 		 483 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0990  heavy metal sensor kinase  65.49 
 
 		 161 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  29.31 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 476 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  34.38 
 
 		 476 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  28.94 
 
 		 464 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  28.94 
 
 		 464 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  28.94 
 
 		 464 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  28.94 
 
 		 464 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  28.94 
 
 		 464 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>