More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3107 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 447 aa  886    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 489 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 487 aa  249  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 486 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  39.13 
 
 		 463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.84 
 
 		 446 aa  242  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  40.91 
 
 		 475 aa  239  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  37.34 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  37.34 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  37.34 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  37.34 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  37.34 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  37.34 
 
 		 464 aa  237  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  38.44 
 
 		 715 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 467 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  43.48 
 
 		 486 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 469 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  40.46 
 
 		 464 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.55 
 
 		 468 aa  230  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 		 462 aa  229  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  41.02 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3464  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 		 461 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 474 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 493 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 467 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3530  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 		 484 aa  226  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  38.8 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 468 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 		 480 aa  223  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  42.76 
 
 		 481 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  39.34 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  36.69 
 
 		 463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.42 
 
 		 469 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 486 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  34.39 
 
 		 477 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  37.97 
 
 		 443 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  42.76 
 
 		 473 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.69 
 
 		 474 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 474 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 474 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 450 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 468 aa  216  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 450 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 465 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 		 477 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  37.11 
 
 		 463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 474 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 		 471 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 475 aa  213  5.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 482 aa  212  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  41.57 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.12 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  40.44 
 
 		 462 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 458 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  37.8 
 
 		 462 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 489 aa  210  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 		 458 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 465 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.87 
 
 		 469 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 465 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 456 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  40.56 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 472 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 472 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 472 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  39.89 
 
 		 462 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 477 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  32.96 
 
 		 467 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  40.33 
 
 		 465 aa  206  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.45 
 
 		 466 aa  206  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 		 470 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  38.98 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.72 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 		 467 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>