More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3841 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  92.62 
 
 
474 aa  867    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
474 aa  953    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  98.52 
 
 
474 aa  938    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  98.52 
 
 
474 aa  938    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  98.92 
 
 
468 aa  925    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  66.23 
 
 
481 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  66.52 
 
 
464 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  66.52 
 
 
464 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  66.52 
 
 
464 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  66.52 
 
 
464 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  66.74 
 
 
464 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  66.52 
 
 
464 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  65.65 
 
 
464 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  66.52 
 
 
715 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  62.06 
 
 
477 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  54.49 
 
 
471 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  54.68 
 
 
468 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  50.86 
 
 
484 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  50.87 
 
 
483 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  50.86 
 
 
484 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  51.82 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
480 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
480 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
464 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 
469 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 
469 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
469 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
472 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  37.12 
 
 
467 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
477 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  37.58 
 
 
463 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
462 aa  249  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  36.32 
 
 
463 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
471 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.91 
 
 
486 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
471 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 
489 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
463 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
474 aa  243  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  36.5 
 
 
465 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
487 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
458 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  46.07 
 
 
486 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
460 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 
477 aa  237  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.19 
 
 
469 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  37.06 
 
 
459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  39.84 
 
 
475 aa  233  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  35.63 
 
 
460 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
460 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
461 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
477 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
472 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
472 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
472 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
472 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35.33 
 
 
462 aa  229  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
489 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  33.99 
 
 
463 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 
493 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
481 aa  227  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
486 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
486 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 
486 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
473 aa  224  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 
475 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 
493 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.48 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  32.9 
 
 
470 aa  221  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.08 
 
 
471 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
467 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
468 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
468 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
468 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  39.81 
 
 
472 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  32.89 
 
 
463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
465 aa  217  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  32.55 
 
 
476 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
476 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  39.5 
 
 
471 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.01 
 
 
466 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  35.64 
 
 
462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  35.89 
 
 
462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
467 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  29.06 
 
 
468 aa  210  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
458 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0203  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 
462 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
467 aa  207  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  32.02 
 
 
482 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  32.09 
 
 
480 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  31.96 
 
 
482 aa  206  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3530  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
484 aa  206  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
480 aa  206  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>