More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3616 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 489 aa  989    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  87.37 
 
 		 482 aa  825    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  48.27 
 
 		 475 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  48.71 
 
 		 477 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3530  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 484 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3464  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 482 aa  249  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.87 
 
 		 480 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 474 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  42.25 
 
 		 484 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  41.9 
 
 		 483 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  42.25 
 
 		 436 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  42.25 
 
 		 484 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 477 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  42.72 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  42.72 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  42.72 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  42.72 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 481 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  42.72 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  42.72 
 
 		 464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 		 486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 		 486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  42.72 
 
 		 715 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 493 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 493 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.47 
 
 		 468 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.33 
 
 		 486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  42.63 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 468 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 474 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 474 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 474 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 471 aa  230  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 462 aa  229  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 467 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  35.51 
 
 		 463 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 447 aa  225  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  40.2 
 
 		 463 aa  225  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  35.84 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 463 aa  224  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 487 aa  223  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 		 486 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  32.84 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 481 aa  220  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  40.52 
 
 		 486 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  41.2 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 		 467 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 472 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 469 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.51 
 
 		 469 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 469 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 469 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 466 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 469 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 473 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  43.52 
 
 		 463 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 463 aa  213  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  43 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  37.18 
 
 		 357 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  34.25 
 
 		 467 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  36.82 
 
 		 357 aa  209  7e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 476 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  33.61 
 
 		 476 aa  209  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  43.71 
 
 		 463 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 477 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 467 aa  206  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 461 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  42.23 
 
 		 455 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 472 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 472 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 472 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 468 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.26 
 
 		 446 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 468 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 468 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 472 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 445 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  41.69 
 
 		 462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 		 458 aa  200  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 471 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 465 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 465 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 467 aa  199  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  38.64 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.1 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  38.12 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 450 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 458 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>