More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3380 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  100 
 
 
471 aa  946    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1380  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  50.76 
 
 
461 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  46.61 
 
 
462 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  47.05 
 
 
462 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 
474 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  45.43 
 
 
463 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  45.21 
 
 
463 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  41.24 
 
 
466 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 
466 aa  329  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
472 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
481 aa  311  2e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0203  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 
462 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
480 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
465 aa  302  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
469 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
469 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.66 
 
 
469 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
480 aa  296  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
471 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
471 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  38.61 
 
 
467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
487 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
469 aa  262  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  38.44 
 
 
465 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  33.76 
 
 
463 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
486 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  34.38 
 
 
486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
461 aa  239  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  34.74 
 
 
462 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
463 aa  233  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.09 
 
 
469 aa  232  9e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
477 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
471 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
493 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
458 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
493 aa  230  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.5 
 
 
468 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 
481 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
469 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  39.38 
 
 
482 aa  227  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  39.38 
 
 
482 aa  227  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  33.11 
 
 
454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.433807 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  39.38 
 
 
482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1054  heavy metal sensor kinase subfamily  33.11 
 
 
454 aa  226  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  42.61 
 
 
472 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
486 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  32.89 
 
 
476 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
476 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 
486 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
467 aa  225  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1170  heavy metal sensor kinase family protein  32.89 
 
 
454 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 
462 aa  225  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  39.31 
 
 
480 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
480 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1205  heavy metal sensor kinase subfamily  32.89 
 
 
454 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
467 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1190  heavy metal sensor kinase subfamily  32.89 
 
 
454 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
472 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
472 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  34.91 
 
 
464 aa  224  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
472 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  39.04 
 
 
482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  39.18 
 
 
482 aa  223  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 
474 aa  223  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  33.77 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  33.77 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  33.77 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  33.77 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  33.77 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
467 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  33.77 
 
 
464 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  33.77 
 
 
715 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
468 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  39.35 
 
 
475 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
474 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 
468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  37.58 
 
 
470 aa  217  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  35.29 
 
 
463 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2069  heavy metal sensor histidine kinase  31.07 
 
 
452 aa  216  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260853  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
461 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  39 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  34.35 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1217  heavy metal sensor histidine kinase  31.07 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00057319  normal  0.58155 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1677  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00542699  normal  0.137628 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0915  heavy metal sensor histidine kinase  31.07 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000246705  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2199  heavy metal sensor histidine kinase  31.07 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01883  predicted sensory kinase in two-component regulatory system with YedW  31.07 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000273191  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01873  hypothetical protein  31.07 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000189435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
468 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
468 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
468 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  33.33 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
473 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  32.21 
 
 
481 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  41.58 
 
 
463 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>