More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0203 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0203  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
462 aa  913    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 
465 aa  362  6e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40.75 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  44.01 
 
 
463 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  44.24 
 
 
463 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
474 aa  319  6e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  42.79 
 
 
462 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  42.79 
 
 
462 aa  315  8e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
480 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 
480 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1380  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  41.7 
 
 
461 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  40.09 
 
 
466 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
481 aa  292  7e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
469 aa  286  7e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
493 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 
472 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
493 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  40.17 
 
 
465 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  40.43 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
486 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  37.34 
 
 
486 aa  266  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 
463 aa  259  7e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
469 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
469 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
469 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
476 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  36.18 
 
 
476 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  36.18 
 
 
463 aa  250  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
471 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
471 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
486 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  35.32 
 
 
455 aa  242  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
486 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
486 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  36.94 
 
 
454 aa  239  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.433807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1054  heavy metal sensor kinase subfamily  36.94 
 
 
454 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
462 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1170  heavy metal sensor kinase family protein  36.94 
 
 
454 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  37.96 
 
 
431 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1190  heavy metal sensor kinase subfamily  37.16 
 
 
454 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1205  heavy metal sensor kinase subfamily  36.71 
 
 
454 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.24 
 
 
446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.79 
 
 
481 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
449 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
473 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
450 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
445 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
462 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
455 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
458 aa  224  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  33.88 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
477 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
467 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1217  heavy metal sensor histidine kinase  33.84 
 
 
452 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00057319  normal  0.58155 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2069  heavy metal sensor histidine kinase  33.84 
 
 
452 aa  219  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260853  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
468 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
461 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
468 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0915  heavy metal sensor histidine kinase  33.84 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000246705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01883  predicted sensory kinase in two-component regulatory system with YedW  33.26 
 
 
452 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000273191  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1677  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
452 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00542699  normal  0.137628 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01873  hypothetical protein  33.26 
 
 
452 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000189435  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2199  heavy metal sensor histidine kinase  33.62 
 
 
452 aa  216  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  44.16 
 
 
463 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 
474 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1683  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000103684  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 
474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 
474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.83 
 
 
462 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 
469 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  30.08 
 
 
491 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  30.08 
 
 
491 aa  212  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
467 aa  212  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  30.09 
 
 
468 aa  212  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.33 
 
 
469 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
474 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2747  heavy metal sensor histidine kinase  33.04 
 
 
452 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000765675  normal  0.226821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
467 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
475 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 
480 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  34.44 
 
 
491 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  40.21 
 
 
480 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 
477 aa  210  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
465 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  34.13 
 
 
464 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.75 
 
 
466 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  40.21 
 
 
482 aa  209  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  33.26 
 
 
463 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  32.55 
 
 
483 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>