More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_15520 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  100 
 
 
431 aa  838    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  62.95 
 
 
450 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  62.02 
 
 
445 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  63.68 
 
 
443 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  60.94 
 
 
450 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  60.8 
 
 
449 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  63.68 
 
 
443 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  59.47 
 
 
446 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.22 
 
 
458 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  47.08 
 
 
463 aa  343  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 
469 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 
468 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 
468 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 
468 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.45 
 
 
468 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  42.95 
 
 
463 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 
465 aa  324  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
467 aa  318  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  43.79 
 
 
459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 
462 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  40.57 
 
 
463 aa  305  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  41.18 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  40.91 
 
 
462 aa  302  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 
465 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.66 
 
 
465 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 
461 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
461 aa  299  6e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 
455 aa  295  9e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
465 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.32 
 
 
467 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
467 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 
475 aa  289  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
467 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  38.91 
 
 
470 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
456 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  39.73 
 
 
455 aa  279  8e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
473 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  35.79 
 
 
468 aa  275  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
480 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
462 aa  270  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.28 
 
 
477 aa  267  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  33.54 
 
 
480 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
480 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  33.54 
 
 
482 aa  260  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  33.76 
 
 
482 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
480 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  33.54 
 
 
482 aa  259  8e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  42.44 
 
 
482 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  33.33 
 
 
482 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  38.04 
 
 
465 aa  256  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  33.4 
 
 
475 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  32.74 
 
 
446 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  33.54 
 
 
491 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  33.05 
 
 
491 aa  249  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  33.33 
 
 
491 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  37.26 
 
 
481 aa  246  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 
472 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
466 aa  243  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  37.04 
 
 
473 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
486 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 
486 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.51 
 
 
493 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.51 
 
 
493 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  44.13 
 
 
486 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
469 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 
458 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 
471 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.08 
 
 
486 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
469 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
464 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
469 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
471 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
465 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 
481 aa  225  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.98 
 
 
469 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
458 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
465 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
470 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  33.92 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
447 aa  221  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  34.14 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  34.14 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  34.14 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  34.14 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  34.14 
 
 
464 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  33.48 
 
 
464 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
481 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  42.86 
 
 
463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2216  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 
487 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  34.14 
 
 
715 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.34 
 
 
466 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  43.93 
 
 
472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  41.84 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  43.34 
 
 
466 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>