More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3721 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
481 aa  966    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  69.28 
 
 
474 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  53.35 
 
 
462 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3604  heavy metal sensor histidine kinase  52.48 
 
 
462 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.514788  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  52.39 
 
 
463 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  52.16 
 
 
463 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  43.5 
 
 
466 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 
466 aa  359  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.83 
 
 
471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1380  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  41.43 
 
 
461 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
472 aa  294  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
480 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
469 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
471 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
469 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
469 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  37.55 
 
 
467 aa  272  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0103  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
465 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0949662  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
471 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
487 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0203  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
462 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
469 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  35.93 
 
 
486 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
486 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
493 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
486 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  34.99 
 
 
476 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
486 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
476 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  34.79 
 
 
465 aa  253  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
493 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
486 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.6 
 
 
469 aa  247  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
458 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
463 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  39.87 
 
 
459 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
481 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
471 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
467 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
462 aa  226  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  35.67 
 
 
431 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
474 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
460 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  40.98 
 
 
463 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
458 aa  223  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 
468 aa  222  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  39.87 
 
 
475 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
474 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
467 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 
474 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  41.02 
 
 
463 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.33 
 
 
468 aa  220  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  38.05 
 
 
460 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  33.63 
 
 
455 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  31.45 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  31.47 
 
 
463 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
466 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
460 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  39.76 
 
 
463 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
461 aa  216  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  40.94 
 
 
462 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  33.4 
 
 
481 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  37.16 
 
 
483 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
477 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  31.08 
 
 
464 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  31.08 
 
 
464 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  31.08 
 
 
464 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  31.08 
 
 
464 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
468 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  31.08 
 
 
464 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 
477 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
450 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  30.74 
 
 
464 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
445 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
462 aa  210  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  35.38 
 
 
468 aa  210  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 
469 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  31.33 
 
 
715 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
467 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  37.13 
 
 
484 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
489 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  34.29 
 
 
443 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  33.82 
 
 
473 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  37.13 
 
 
436 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
468 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
468 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 
468 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
482 aa  206  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  36.81 
 
 
484 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
467 aa  206  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  31.05 
 
 
446 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1159  heavy metal sensor kinase subfamily  33.19 
 
 
454 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.433807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1190  heavy metal sensor kinase subfamily  33.62 
 
 
454 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1054  heavy metal sensor kinase subfamily  33.19 
 
 
454 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  36.17 
 
 
471 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
449 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>