More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5673 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  100 
 
 
462 aa  941    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  65.73 
 
 
465 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  61.09 
 
 
465 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  61.09 
 
 
465 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  63.6 
 
 
461 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  60.82 
 
 
465 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  61.32 
 
 
463 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  59.65 
 
 
466 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  57.39 
 
 
456 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  56.96 
 
 
456 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  50.65 
 
 
461 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  50.87 
 
 
467 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  51.1 
 
 
467 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.53 
 
 
462 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  45.65 
 
 
463 aa  365  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 
445 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 
463 aa  330  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.67 
 
 
446 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
467 aa  322  9.000000000000001e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
450 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
449 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
450 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  38.68 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  40.91 
 
 
431 aa  302  8.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
467 aa  302  9e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 
473 aa  300  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
458 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
468 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
469 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  35.59 
 
 
446 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
468 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
468 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
468 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  39.87 
 
 
443 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 
475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  39.57 
 
 
443 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  35.26 
 
 
482 aa  276  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  35.34 
 
 
482 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  35.05 
 
 
482 aa  274  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  35.05 
 
 
482 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
477 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  36.8 
 
 
455 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  35.34 
 
 
482 aa  270  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  37.74 
 
 
459 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  35.07 
 
 
475 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  35.07 
 
 
480 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
461 aa  262  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3411  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
466 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.648729  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  34.85 
 
 
468 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  32.01 
 
 
491 aa  261  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  31.58 
 
 
491 aa  257  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
480 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  31.57 
 
 
491 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
486 aa  254  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  46.15 
 
 
460 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
487 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 
460 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  35.04 
 
 
463 aa  249  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.67 
 
 
469 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
460 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
480 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  33.33 
 
 
486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
462 aa  243  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  35.64 
 
 
465 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  42.01 
 
 
472 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  41.88 
 
 
471 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  40.47 
 
 
463 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
465 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
477 aa  237  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
472 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
472 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
472 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  35 
 
 
472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
474 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
481 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
458 aa  229  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  33.33 
 
 
484 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  39.13 
 
 
463 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
474 aa  228  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  32.83 
 
 
483 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  31.67 
 
 
454 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  33.33 
 
 
484 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
493 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  41.97 
 
 
436 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.76 
 
 
471 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
493 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  38.84 
 
 
463 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
489 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
470 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
477 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
468 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1380  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  35.12 
 
 
461 aa  223  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
486 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.97 
 
 
486 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  38.14 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>