More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1173 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 477 aa  966    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  53.26 
 
 		 463 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  52.58 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  53.46 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.17 
 
 		 472 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  46.96 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.17 
 
 		 472 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.17 
 
 		 472 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  51.09 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  51.3 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  51.3 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  46.79 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  46.02 
 
 		 472 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.27 
 
 		 458 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 480 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  33.69 
 
 		 483 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  34.06 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 481 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  33.84 
 
 		 484 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 471 aa  253  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 480 aa  252  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.94 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 474 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 468 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 474 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 474 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  35.85 
 
 		 464 aa  243  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 461 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1179  sensor histidine kinase IrlS  35.26 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.988486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1027  sensor histidine kinase IrlS  35.26 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.129197  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0403  sensor histidine kinase IrlS  35.26 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479639  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  40.06 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1438  sensor histidine kinase IrlS  35.26 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0009  sensor histidine kinase IrlS  35.26 
 
 		 464 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142023  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  32.83 
 
 		 465 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1523  sensor protein IrlS  35.26 
 
 		 464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.134108  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0029  IrlS  35.04 
 
 		 715 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 474 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 456 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  37 
 
 		 462 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 477 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 469 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  40 
 
 		 466 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  34.6 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 475 aa  230  5e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  38.96 
 
 		 463 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.55 
 
 		 465 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 467 aa  228  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 465 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 467 aa  227  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 		 461 aa  225  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 458 aa  225  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 474 aa  223  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 		 450 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 486 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  44.49 
 
 		 450 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 469 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 469 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.21 
 
 		 449 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  35.64 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  32.24 
 
 		 486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  34.27 
 
 		 459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 481 aa  213  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.24 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 477 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 458 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  44.06 
 
 		 431 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  32.04 
 
 		 467 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 489 aa  209  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  33.13 
 
 		 491 aa  209  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  31.26 
 
 		 466 aa  209  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 471 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  33 
 
 		 491 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 487 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 477 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 471 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39 
 
 		 471 aa  206  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  42.5 
 
 		 443 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 493 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>