More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1712 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1712  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 462 aa  927    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1092  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  56.73 
 
 		 464 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2389  heavy metal sensor kinase  48.42 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0021647  normal  0.121803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2102  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  48.42 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2216  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 		 457 aa  358  9e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1630  putative two-component sensor  46.26 
 
 		 453 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0454347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3560  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  43.54 
 
 		 444 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0861327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1126  heavy metal sensor kinase  34.26 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470151  normal  0.220682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 458 aa  227  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1306  heavy metal sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4664  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.26 
 
 		 454 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0247649  normal  0.268867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  32.32 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  32.4 
 
 		 481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4392  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 		 470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0835  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 		 465 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 494 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 494 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 468 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 468 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 468 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 479 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 482 aa  209  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 494 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6518  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 485 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2068  heavy metal sensor signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.55 
 
 		 484 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00178003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 469 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  31.86 
 
 		 463 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  40.33 
 
 		 480 aa  202  7e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  39.53 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  39.53 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  39.53 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5872  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 		 485 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  39.53 
 
 		 482 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 480 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  39.2 
 
 		 482 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.68 
 
 		 446 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  31.75 
 
 		 443 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2085  heavy metal sensor histidine kinase  38.25 
 
 		 461 aa  196  8.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000557758  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1499  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 474 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2193  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 461 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2481  heavy metal sensor histidine kinase  37.95 
 
 		 461 aa  196  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000221939  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  32.18 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  40 
 
 		 475 aa  195  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 450 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 469 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 469 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 471 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 480 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.72 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.61 
 
 		 469 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 480 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 463 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  34.52 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 472 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1674  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 463 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2258  heavy metal sensor kinase  32.31 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  34.82 
 
 		 483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  35.58 
 
 		 470 aa  183  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 		 464 aa  182  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 477 aa  182  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  29.96 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1377  sensor protein irlS  30.34 
 
 		 464 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598293  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  32.22 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  32.22 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  27.54 
 
 		 484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3375  heavy metal sensor kinase  40.67 
 
 		 462 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 460 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.86 
 
 		 471 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  31.89 
 
 		 460 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.23 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 473 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 465 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 465 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  35.26 
 
 		 491 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  32.46 
 
 		 472 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>