More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1940 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  100 
 
 		 436 aa  867    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.19 
 
 		 416 aa  531  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  57.18 
 
 		 413 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  55.76 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  55.23 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.47 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  47.31 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.67 
 
 		 426 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  45.71 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  52.07 
 
 		 403 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 		 401 aa  259  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.27 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  46.73 
 
 		 389 aa  256  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  44.32 
 
 		 389 aa  255  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.96 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  45.37 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  47.12 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.87 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  46.11 
 
 		 362 aa  235  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  38.85 
 
 		 391 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  43.13 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  39.18 
 
 		 398 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 378 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 473 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  39.21 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 378 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 373 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.79 
 
 		 362 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  39.19 
 
 		 382 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  36.53 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 357 aa  176  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.532357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  35.83 
 
 		 405 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  37.87 
 
 		 367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 469 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  32.06 
 
 		 461 aa  159  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 438 aa  159  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  31.71 
 
 		 343 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3986  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 467 aa  156  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4056  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 467 aa  156  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  37.94 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 504 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 459 aa  154  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  37.19 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 469 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 475 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.23 
 
 		 486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 534 aa  146  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  35.34 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  37.24 
 
 		 583 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 468 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 458 aa  144  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26830  signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 		 368 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 477 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 470 aa  142  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  34.64 
 
 		 469 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0777  histidine kinase  32.99 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.147887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 469 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 472 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  31.6 
 
 		 592 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 489 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  32.35 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 487 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  35.76 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  33.13 
 
 		 475 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 469 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 420 aa  136  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  31.6 
 
 		 482 aa  136  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  31.6 
 
 		 475 aa  136  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.59 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.7 
 
 		 477 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 490 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  31.65 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 464 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  34.72 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  29.88 
 
 		 482 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  31.25 
 
 		 482 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  34.09 
 
 		 486 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>