More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0452 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  100 
 
 		 469 aa  935    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  81.08 
 
 		 470 aa  756    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.37 
 
 		 469 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  44.35 
 
 		 477 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 459 aa  277  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  35.27 
 
 		 469 aa  252  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  35.08 
 
 		 461 aa  247  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 469 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 438 aa  241  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  35.1 
 
 		 481 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 484 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 509 aa  230  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  36.22 
 
 		 466 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.35 
 
 		 466 aa  223  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 495 aa  223  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 469 aa  220  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  33.19 
 
 		 477 aa  220  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 462 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  30.84 
 
 		 490 aa  213  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  32.78 
 
 		 471 aa  207  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.69 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  31.67 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 472 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  29.27 
 
 		 469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  37.13 
 
 		 448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0654  two component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.23 
 
 		 466 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.688778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 473 aa  197  5.000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 472 aa  196  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1717  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.509729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  35.44 
 
 		 592 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 463 aa  195  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5334  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1842  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 456 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000009553 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5098  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 		 456 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0940065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  28.93 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 477 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  34.32 
 
 		 478 aa  193  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1059  sensor histidine kinase  39.86 
 
 		 473 aa  193  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.10662  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 524 aa  193  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 475 aa  193  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  30 
 
 		 448 aa  192  9e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  28.84 
 
 		 472 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 491 aa  192  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  28.84 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 462 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  31.08 
 
 		 457 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  31.08 
 
 		 457 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 585 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 464 aa  189  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  37.27 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  30.48 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 468 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 551 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0818729  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 500 aa  187  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 461 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 500 aa  186  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 469 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 469 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1781  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 465 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.639681  normal  0.950825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 		 535 aa  186  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  33.11 
 
 		 357 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 463 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  33.92 
 
 		 463 aa  186  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  37.59 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  31.82 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6110  two component sensor CopS  35.02 
 
 		 463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.639029  normal  0.117602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  31.17 
 
 		 436 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 489 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  30.37 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  33.56 
 
 		 357 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  36.18 
 
 		 462 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  34.56 
 
 		 482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  34.56 
 
 		 482 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  34.56 
 
 		 482 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 522 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>