More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0316 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  100 
 
 		 469 aa  918    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  30.29 
 
 		 477 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 469 aa  206  7e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  29.27 
 
 		 469 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 470 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2336  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 473 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 447 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 495 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 459 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  29.73 
 
 		 470 aa  186  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2038  ATP-binding region ATPase domain protein  29.54 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  34.82 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  30.68 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 489 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  30.63 
 
 		 491 aa  183  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.4 
 
 		 469 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  30.12 
 
 		 491 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  33.89 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1750  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  31.49 
 
 		 482 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  31.49 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  31.49 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 480 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3059  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 480 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  30.15 
 
 		 482 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 500 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 455 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  31.17 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  29.1 
 
 		 463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  25.64 
 
 		 469 aa  173  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  29.76 
 
 		 480 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 480 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3259  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 462 aa  169  9e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00819393  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 438 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00520  hypothetical protein  31.16 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  29.39 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  32.54 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  33.11 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  30.64 
 
 		 476 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  31.58 
 
 		 481 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 486 aa  167  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  29.32 
 
 		 463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  30.96 
 
 		 466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0343  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 475 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  26.76 
 
 		 468 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  27.78 
 
 		 489 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 489 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.06 
 
 		 478 aa  163  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1752  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.13 
 
 		 469 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699365  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 460 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 493 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 509 aa  160  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5743  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 493 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0671163  normal  0.699165 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 482 aa  159  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  30.79 
 
 		 459 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3380  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.66 
 
 		 471 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 463 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.67 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  30.51 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  30.31 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  29.82 
 
 		 473 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6325  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0648757  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 472 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1504  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0798501  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  27.19 
 
 		 466 aa  156  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 472 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1814  heavy metal sensor kinase  27.8 
 
 		 467 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 472 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  32 
 
 		 456 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 472 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  24.73 
 
 		 472 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5872  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 485 aa  156  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  34.49 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  29.55 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6988  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.347987  normal  0.65716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64580  putative two-component sensor  30.55 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  28.04 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  28.04 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  27.42 
 
 		 483 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  28.04 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5609  putative two-component sensor  29.82 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 480 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>