More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0512 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  100 
 
 
489 aa  967    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
459 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  31.89 
 
 
469 aa  174  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  30.3 
 
 
475 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  32.97 
 
 
448 aa  171  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
469 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  34.78 
 
 
463 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  34.11 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  34.44 
 
 
463 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  30.66 
 
 
448 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
477 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  27.78 
 
 
469 aa  162  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
489 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  34.01 
 
 
477 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  33.75 
 
 
592 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  30.39 
 
 
477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  35.5 
 
 
478 aa  157  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
470 aa  156  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
489 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
474 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
462 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
495 aa  154  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.21 
 
 
461 aa  153  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0488  transmembrane sensory transduction histidine kinase for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  36.1 
 
 
465 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637109  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.87 
 
 
466 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  34.51 
 
 
469 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.82 
 
 
466 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  30.7 
 
 
456 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2744  histidine kinase  26.65 
 
 
455 aa  151  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4794  histidine kinase  34.35 
 
 
454 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  38.13 
 
 
471 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  34.35 
 
 
477 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
458 aa  150  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
482 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2756  ATP-binding region ATPase domain protein  32.56 
 
 
474 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
515 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
515 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  31.65 
 
 
466 aa  148  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  28.77 
 
 
458 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  36.36 
 
 
472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
545 aa  146  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30.28 
 
 
486 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
524 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  34.52 
 
 
471 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
462 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
452 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  26.53 
 
 
460 aa  143  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4055  histidine kinase  34.12 
 
 
455 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
500 aa  143  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  33.71 
 
 
474 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
468 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  28.43 
 
 
357 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  31.09 
 
 
468 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
517 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  29.38 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
468 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  31.77 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3625  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30.43 
 
 
469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2267  histidine kinase  33.51 
 
 
488 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.643176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.75 
 
 
462 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  32.76 
 
 
817 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
477 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
465 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
519 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  29.27 
 
 
463 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
463 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  29.81 
 
 
463 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  29.81 
 
 
463 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
473 aa  139  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  31.02 
 
 
466 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  37.15 
 
 
487 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
471 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  31.51 
 
 
466 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  31.51 
 
 
466 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  27.12 
 
 
458 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  31.51 
 
 
466 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  31.51 
 
 
466 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.21 
 
 
486 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  26.56 
 
 
458 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  31.51 
 
 
466 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  27.12 
 
 
458 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  25.99 
 
 
463 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
478 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31950  putative two-component sensor  34.3 
 
 
472 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.578717  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
460 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  27.74 
 
 
458 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  27.6 
 
 
357 aa  139  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  32.27 
 
 
518 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
515 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
581 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  26.85 
 
 
458 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>