More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1027 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  100 
 
 		 477 aa  963    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 438 aa  194  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  37.01 
 
 		 592 aa  189  7e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 469 aa  189  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 469 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  32.67 
 
 		 448 aa  183  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.03 
 
 		 461 aa  183  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  32.27 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  36.36 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  34.69 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  33.99 
 
 		 477 aa  181  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  31.64 
 
 		 466 aa  179  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 455 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  31.99 
 
 		 448 aa  177  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.13 
 
 		 469 aa  176  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 452 aa  174  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  29.22 
 
 		 482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 524 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 469 aa  166  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  29.92 
 
 		 481 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 489 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  33.8 
 
 		 469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 467 aa  162  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 515 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  33.7 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2202  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 467 aa  160  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 462 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  26.72 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  29.29 
 
 		 462 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  30.31 
 
 		 497 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  33.81 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  36.82 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  31.56 
 
 		 457 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  29.67 
 
 		 471 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1850  histidine kinase  33.44 
 
 		 458 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  32.23 
 
 		 436 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 484 aa  157  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.69 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 484 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  31.77 
 
 		 436 aa  156  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  31.44 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 466 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 504 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  31.89 
 
 		 457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  31.89 
 
 		 457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  33.78 
 
 		 566 aa  153  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  31.64 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  29.81 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  30.72 
 
 		 508 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 470 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  30.67 
 
 		 386 aa  152  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  32.64 
 
 		 478 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 466 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  27.86 
 
 		 482 aa  149  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  27.86 
 
 		 482 aa  149  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  27.86 
 
 		 482 aa  149  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 350 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  30.8 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2491  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  27.84 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  29.68 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00314  sensory histidine kinase in two-component region  29.35 
 
 		 468 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  34.2 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  34.2 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  27.93 
 
 		 555 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2157  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  34.2 
 
 		 416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  34.2 
 
 		 416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  29.85 
 
 		 491 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  32.92 
 
 		 475 aa  147  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  33.48 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3585  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 449 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5977  sensor histidine kinase  26.17 
 
 		 476 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000115745  normal  0.0809179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1698  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 450 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1759  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 476 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804267  normal  0.497345 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  27.58 
 
 		 482 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  33.76 
 
 		 436 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 455 aa  146  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0650  sensor kinase CusS  28.25 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0587  sensor kinase CusS  27.58 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.807455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001640  signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 500 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>