More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2317 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
524 aa  1031    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.2 
 
 
475 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  43.69 
 
 
473 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  38.95 
 
 
486 aa  209  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
459 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
438 aa  204  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
484 aa  203  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  32.31 
 
 
490 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  35.31 
 
 
461 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
469 aa  194  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
452 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  31.54 
 
 
477 aa  194  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  38.21 
 
 
503 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  37.93 
 
 
477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  37.89 
 
 
469 aa  191  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
509 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
470 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  38.29 
 
 
469 aa  186  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
471 aa  186  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  33.84 
 
 
497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
480 aa  183  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
469 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
614 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
504 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
641 aa  179  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  33.06 
 
 
471 aa  179  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  33.15 
 
 
471 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
614 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  35.85 
 
 
436 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
640 aa  177  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
639 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
545 aa  177  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
469 aa  177  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  34.29 
 
 
452 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  34.29 
 
 
452 aa  176  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  34.69 
 
 
457 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  34.2 
 
 
477 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 
513 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  36.31 
 
 
592 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  33.97 
 
 
452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
639 aa  173  5e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  31.58 
 
 
482 aa  173  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  35.22 
 
 
457 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  36 
 
 
508 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
472 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  35.22 
 
 
457 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  29.46 
 
 
475 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
639 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  33.44 
 
 
436 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  34.59 
 
 
436 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
613 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 
491 aa  170  7e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  36.28 
 
 
527 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
515 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  37 
 
 
467 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.65 
 
 
468 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
524 aa  169  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
465 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  33.02 
 
 
452 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
495 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  31.69 
 
 
472 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
534 aa  167  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  31.83 
 
 
648 aa  167  5.9999999999999996e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
489 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
635 aa  166  9e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  31.72 
 
 
471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  32 
 
 
483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
620 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
475 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  36.24 
 
 
443 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
500 aa  163  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  36.24 
 
 
443 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
477 aa  163  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  37.54 
 
 
466 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  30.26 
 
 
520 aa  163  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2870  sensor protein IrlS  31.61 
 
 
484 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
501 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.414231  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2717  heavy metal sensor histidine kinase  31.61 
 
 
484 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  35.81 
 
 
583 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
451 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1104  IrlS  31.61 
 
 
436 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  31.02 
 
 
451 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  31.39 
 
 
471 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  29.64 
 
 
463 aa  161  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
504 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  36.24 
 
 
507 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  37.68 
 
 
496 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
586 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
500 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
466 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.83 
 
 
447 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
457 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  37.99 
 
 
471 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
504 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4259  ATP-binding region ATPase domain protein  34.38 
 
 
508 aa  160  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0361398  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
458 aa  160  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  29.03 
 
 
463 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>