More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5017 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  100 
 
 
427 aa  882    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  57.28 
 
 
430 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  57.28 
 
 
430 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  45.29 
 
 
443 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  44.79 
 
 
412 aa  346  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  43.61 
 
 
436 aa  335  7e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  43.61 
 
 
436 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  32.29 
 
 
439 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
444 aa  206  6e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
454 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3627  histidine kinase  40.85 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2486  histidine kinase  40.49 
 
 
454 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
436 aa  199  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  37.85 
 
 
336 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3159  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
475 aa  196  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3727  histidine kinase  31.83 
 
 
457 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.661917  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  41.86 
 
 
443 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 
445 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
470 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  29.5 
 
 
469 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
454 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
469 aa  179  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
420 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
452 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 
419 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3210  histidine kinase  27.36 
 
 
515 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.625161 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  35.71 
 
 
416 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  34.64 
 
 
392 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  34.64 
 
 
416 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  34.64 
 
 
416 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  34.64 
 
 
416 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  37.14 
 
 
429 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  33.93 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  27.44 
 
 
469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 
469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
403 aa  162  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  34.89 
 
 
416 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  34.62 
 
 
518 aa  162  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  34.77 
 
 
392 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2646  two-component sensor histidine kinase  29.6 
 
 
438 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.682942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
587 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
504 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
436 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
452 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  38.65 
 
 
587 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  33.57 
 
 
416 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  34.53 
 
 
416 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  38.65 
 
 
587 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  38.25 
 
 
587 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
459 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  38.25 
 
 
587 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  38.25 
 
 
587 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  38.25 
 
 
587 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  37.14 
 
 
337 aa  159  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
585 aa  159  8e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  38.25 
 
 
587 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  38.25 
 
 
587 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  34.94 
 
 
527 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
509 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  37.85 
 
 
587 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 
406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  32.2 
 
 
490 aa  156  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  37.6 
 
 
477 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  38.26 
 
 
463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  38.5 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
418 aa  154  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  34.85 
 
 
436 aa  154  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
466 aa  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 
496 aa  152  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
467 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
589 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
478 aa  151  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1809  Signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
432 aa  150  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000615791  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
607 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  32.59 
 
 
430 aa  150  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  37.07 
 
 
257 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  39.29 
 
 
591 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  33.74 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  34.71 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  38.33 
 
 
537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
451 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
592 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  36.17 
 
 
486 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
384 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  38.53 
 
 
477 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  33.48 
 
 
477 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
464 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0527  histidine kinase  30.51 
 
 
425 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 
524 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
458 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  28.41 
 
 
463 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  36.96 
 
 
510 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
467 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  36.49 
 
 
571 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
475 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
584 aa  143  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>