More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1045 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1045  histidine kinase  100 
 
 		 457 aa  943    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00270  signal transduction histidine kinase  58.35 
 
 		 447 aa  542  1e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000230413 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1333  histidine kinase  74.09 
 
 		 226 aa  352  7e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000137869  decreased coverage  0.000238136 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1057  sensor histidine kinase  47 
 
 		 418 aa  288  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  40.73 
 
 		 494 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  44.84 
 
 		 397 aa  217  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  32.68 
 
 		 497 aa  187  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 513 aa  158  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1700  Signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0217075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  34.12 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 471 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  32.94 
 
 		 472 aa  153  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  37.3 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  37.3 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 469 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0736  histidine kinase  32.43 
 
 		 508 aa  149  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 366 aa  149  7e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  33.66 
 
 		 477 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  35.97 
 
 		 452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  36.89 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  31.23 
 
 		 490 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 471 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  33.08 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  34.28 
 
 		 481 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0492  sensor histidine kinase/response regulator  30.82 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  30.41 
 
 		 506 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0988  sensor histidine kinase ArlS  34.44 
 
 		 456 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101467  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  33.72 
 
 		 471 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  31.41 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  32.17 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 509 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 384 aa  140  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 465 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 475 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.42 
 
 		 503 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  31.1 
 
 		 483 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 479 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 504 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 515 aa  137  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 423 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  30.03 
 
 		 477 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  34.69 
 
 		 527 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  29.11 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  34.03 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  31.48 
 
 		 555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  35 
 
 		 486 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  33.61 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  34.18 
 
 		 416 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 392 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 490 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.8 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 585 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  35.69 
 
 		 477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 484 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  33.62 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  35.56 
 
 		 592 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.27 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  32.91 
 
 		 416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3933  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  32.19 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 416 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 392 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 589 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  33.2 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 365 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0489  Signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  33.61 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  31.23 
 
 		 507 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 601 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  32.41 
 
 		 491 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  27.84 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 815 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 524 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  31.56 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0143  Signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2267  histidine kinase  32 
 
 		 488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.643176  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  35.45 
 
 		 497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 		 571 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  29.47 
 
 		 473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 522 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0613  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 472 aa  127  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0773099  normal  0.773415 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 480 aa  126  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 441 aa  126  9e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 498 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  31.54 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>