More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1297 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3727  histidine kinase  70.51 
 
 
457 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.661917  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
445 aa  910    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3159  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  61.18 
 
 
475 aa  553  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.28 
 
 
454 aa  535  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  57.72 
 
 
439 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3210  histidine kinase  52.88 
 
 
515 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.625161 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1586  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.79 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.631328  normal  0.769342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
419 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  36.91 
 
 
412 aa  209  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1415  histidine kinase  34.95 
 
 
430 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1444  histidine kinase  34.95 
 
 
430 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31 
 
 
420 aa  201  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4629  histidine kinase  33.41 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000316217 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
454 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  33.48 
 
 
436 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  31.73 
 
 
427 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  33.26 
 
 
436 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 
436 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0486  histidine kinase  29.34 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4730  Two component system histidine kinase  29.5 
 
 
416 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0609  Two component system histidine kinase  28.98 
 
 
416 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5304  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
444 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0483  sensor histidine kinase  35.44 
 
 
416 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0628  sensor histidine kinase  35.44 
 
 
392 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0541  sensor histidine kinase  35.44 
 
 
416 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0572  sensor histidine kinase  35.44 
 
 
416 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0703  sensor histidine kinase  35.71 
 
 
392 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0635  sensor histidine kinase  34.74 
 
 
416 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2486  histidine kinase  30.33 
 
 
454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
509 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0485  sensor histidine kinase  34.74 
 
 
416 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3627  histidine kinase  30.33 
 
 
454 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
504 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1545  histidine kinase  36.54 
 
 
443 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
452 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  32.3 
 
 
477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  28.86 
 
 
486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
470 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
474 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  29.14 
 
 
481 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
475 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
459 aa  153  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  27.68 
 
 
490 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  31.03 
 
 
336 aa  149  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  27.52 
 
 
469 aa  149  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 
469 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
469 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 
585 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5188  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 
482 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000262234 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
590 aa  143  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  27.08 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
436 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00289243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
597 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
597 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.4 
 
 
469 aa  140  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  35.51 
 
 
429 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0800  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
403 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  34.23 
 
 
436 aa  139  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 
457 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  33.2 
 
 
397 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  35.51 
 
 
587 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  35.51 
 
 
587 aa  137  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  35.51 
 
 
587 aa  137  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  35.51 
 
 
587 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  35.51 
 
 
587 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  35.1 
 
 
587 aa  136  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  35.1 
 
 
587 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  35.1 
 
 
587 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  35.1 
 
 
587 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  27.86 
 
 
527 aa  134  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
587 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  25.36 
 
 
461 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  38.06 
 
 
496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  37.3 
 
 
599 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
639 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 
455 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
1010 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
524 aa  131  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  35.48 
 
 
257 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
815 aa  131  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
458 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  36.58 
 
 
477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.46 
 
 
468 aa  130  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  34.98 
 
 
463 aa  130  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.65 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
584 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 
612 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2646  two-component sensor histidine kinase  33.71 
 
 
438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.682942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  37.2 
 
 
457 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
471 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  37.2 
 
 
436 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>