More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3285 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 478 aa  946    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  58.14 
 
 		 498 aa  498  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.22 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.37 
 
 		 482 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.74 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.74 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.74 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11000  two component system sensor kinase mprB  51.54 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000433123  normal  0.966501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  48.28 
 
 		 471 aa  353  5e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0613  histidine kinase  48.04 
 
 		 476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32760  signal transduction histidine kinase  48.78 
 
 		 449 aa  333  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  42.65 
 
 		 524 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  38.89 
 
 		 542 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.55 
 
 		 523 aa  297  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.02 
 
 		 464 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  38.38 
 
 		 472 aa  259  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  48.41 
 
 		 566 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2631  histidine kinase  53.82 
 
 		 529 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.31 
 
 		 543 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 		 675 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.223849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 		 526 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.14 
 
 		 482 aa  223  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0467  histidine kinase  48.53 
 
 		 451 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.928659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.12 
 
 		 491 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.449609  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0344  signal transduction histidine kinase  39.27 
 
 		 479 aa  186  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2885  ATPase domain-containing protein  39.56 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2915  histidine kinase  39.24 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  30.74 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  37.85 
 
 		 481 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  31.62 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  26.71 
 
 		 472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.43 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  26.12 
 
 		 471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  32.92 
 
 		 463 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  25.7 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  33.64 
 
 		 466 aa  151  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0452  histidine kinase  26.88 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.926339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 509 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  33.44 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.97 
 
 		 461 aa  148  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  34.67 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  32.14 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 463 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  36.88 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 448 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 460 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 425 aa  144  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 457 aa  144  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 504 aa  144  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.31 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  34.31 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000430471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  27.37 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  33.22 
 
 		 455 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  38.3 
 
 		 517 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.19 
 
 		 370 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2785  sensor histidine kinase  25.91 
 
 		 512 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  33.44 
 
 		 450 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  34.32 
 
 		 518 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 518 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.5 
 
 		 466 aa  140  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  31.09 
 
 		 463 aa  140  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3847  osmolarity sensor protein  29.57 
 
 		 438 aa  140  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 515 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  36.9 
 
 		 467 aa  139  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 504 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  26.98 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  36.71 
 
 		 487 aa  139  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 545 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 462 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  27.04 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  23.59 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  35.53 
 
 		 583 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  35.67 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.16 
 
 		 1162 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.13 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 639 aa  139  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 463 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 639 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  33.43 
 
 		 499 aa  137  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  26.95 
 
 		 310 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  30.49 
 
 		 440 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>