More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4875 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
461 aa  911    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  33.69 
 
 
478 aa  216  8e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  33.69 
 
 
478 aa  216  8e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  34.79 
 
 
441 aa  216  9e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 
433 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  32.72 
 
 
471 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  32.98 
 
 
471 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  35.46 
 
 
442 aa  210  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
450 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  38.62 
 
 
438 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
450 aa  206  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
458 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
458 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
461 aa  203  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  35.73 
 
 
455 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  37.83 
 
 
438 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
438 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
448 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
449 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  33.78 
 
 
449 aa  193  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
480 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  35.86 
 
 
444 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
456 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
462 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
467 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  33.69 
 
 
438 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  33.69 
 
 
438 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  33.97 
 
 
438 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  33.97 
 
 
438 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  33.69 
 
 
438 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  33.69 
 
 
438 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  33.69 
 
 
438 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  33.81 
 
 
467 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  33.55 
 
 
438 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
445 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
445 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  34.65 
 
 
459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  34.47 
 
 
459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  34.47 
 
 
459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  34.47 
 
 
459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  34.47 
 
 
459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  36.99 
 
 
463 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
471 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0852151  hitchhiker  0.00000251535 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.85 
 
 
513 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  37.28 
 
 
452 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00403  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.83 
 
 
492 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00328679  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
515 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  34.21 
 
 
449 aa  180  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
531 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  34.05 
 
 
459 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  34.47 
 
 
1093 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  36.81 
 
 
526 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 
448 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
450 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3012  histidine kinase  35.79 
 
 
475 aa  179  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.07 
 
 
515 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
443 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
443 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
443 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.81 
 
 
505 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
517 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
515 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.81 
 
 
505 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  37.58 
 
 
523 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
448 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  37.25 
 
 
518 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  34.27 
 
 
448 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
448 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  33.94 
 
 
446 aa  176  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3522  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
485 aa  176  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
519 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
462 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.55 
 
 
505 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
444 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.55 
 
 
505 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  34.96 
 
 
454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4241  sensor protein QseC  30.63 
 
 
449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  36.84 
 
 
817 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  37.67 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  34.01 
 
 
446 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
450 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1323  histidine kinase  35.09 
 
 
495 aa  173  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.871944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.93 
 
 
524 aa  173  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  36.81 
 
 
517 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
515 aa  172  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
517 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
517 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
515 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4178  sensor protein QseC  33.64 
 
 
449 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.4 
 
 
443 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  35.74 
 
 
439 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  33.65 
 
 
501 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5865  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
462 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  37.79 
 
 
517 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3609  histidine kinase  34.02 
 
 
498 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.708501  normal  0.855271 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4686  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
498 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.226559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>