More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2785 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2785  sensor histidine kinase  100 
 
 		 512 aa  1046    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  35.79 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 433 aa  187  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 449 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  26.95 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 448 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 445 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 445 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  29.19 
 
 		 441 aa  172  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  28.66 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  28.16 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  28.16 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 450 aa  167  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  28.36 
 
 		 438 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  30 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 458 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 450 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  27.92 
 
 		 471 aa  160  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 448 aa  160  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  26.82 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  27.71 
 
 		 471 aa  159  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  26.82 
 
 		 478 aa  159  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  29.58 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  28.1 
 
 		 443 aa  158  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 		 466 aa  157  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 433 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02325  signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 454 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280945  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 515 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  30.21 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  30.43 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  31.08 
 
 		 438 aa  154  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 515 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.01 
 
 		 515 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  26.99 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  27.35 
 
 		 487 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  28.09 
 
 		 472 aa  151  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  29.97 
 
 		 817 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  29.27 
 
 		 469 aa  149  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  29.97 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  29.65 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 517 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 444 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 465 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000014063  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00272877  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  27.72 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  26.07 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  29.65 
 
 		 523 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2398  histidine kinase  27.78 
 
 		 465 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00201135  normal  0.0208658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 454 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.75 
 
 		 513 aa  147  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 455 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 450 aa  147  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 455 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1129  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 467 aa  147  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 458 aa  146  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 465 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 519 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  25.46 
 
 		 467 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  26.75 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1941  histidine kinase  31.25 
 
 		 514 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  26.75 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 500 aa  146  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  26.75 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  32.49 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 515 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  26.75 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  26.75 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  30.67 
 
 		 463 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  26.5 
 
 		 1093 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  31.78 
 
 		 526 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 462 aa  143  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  29.19 
 
 		 517 aa  143  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 466 aa  143  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 515 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  28.88 
 
 		 501 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2082  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0367152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 454 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 531 aa  141  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 524 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 438 aa  140  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>