More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4357 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  90.69 
 
 		 455 aa  774    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  98.69 
 
 		 458 aa  899    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  91.25 
 
 		 461 aa  815    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  90.69 
 
 		 455 aa  774    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 458 aa  910    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  89.06 
 
 		 456 aa  768    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  90.69 
 
 		 455 aa  777    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  71.24 
 
 		 459 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  71.24 
 
 		 459 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  71.24 
 
 		 459 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  71.24 
 
 		 459 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  71.24 
 
 		 459 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  71.24 
 
 		 1093 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  69.89 
 
 		 449 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 445 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  39.15 
 
 		 438 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  38.03 
 
 		 442 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  38.62 
 
 		 438 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  38.62 
 
 		 438 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  38.62 
 
 		 438 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  38.62 
 
 		 438 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  38.62 
 
 		 438 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  38.62 
 
 		 438 aa  272  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  38.62 
 
 		 438 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.9 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  38.24 
 
 		 441 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 448 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  39.46 
 
 		 448 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 448 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 448 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  40.49 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  41.75 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3963  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 475 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  36.98 
 
 		 449 aa  242  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 480 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 438 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  40.52 
 
 		 438 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 454 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5797  two-component regulatory system sensory histidine kinase  39.87 
 
 		 443 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  42.9 
 
 		 499 aa  236  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 450 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.97 
 
 		 513 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 531 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  36.49 
 
 		 526 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0687  histidine kinase  35.78 
 
 		 446 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  35.17 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 501 aa  216  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  35.17 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  34.69 
 
 		 487 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  34.33 
 
 		 463 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 524 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  33.83 
 
 		 467 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3457  putative signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 453 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.805731  normal  0.295467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  42.71 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0275  histidine kinase  36.66 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.395189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 439 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 461 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 446 aa  206  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2031  sensor histidine kinase  34.68 
 
 		 435 aa  204  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.465234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 435 aa  204  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 515 aa  203  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  34.76 
 
 		 471 aa  203  7e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  34.76 
 
 		 471 aa  203  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  33.63 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3403  two-component sensor kinase transcription regulator protein  35.48 
 
 		 446 aa  201  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 		 476 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 515 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  40.56 
 
 		 517 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 		 463 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.72 
 
 		 463 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  41.72 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 450 aa  196  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 449 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  40.91 
 
 		 517 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 484 aa  196  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 471 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  43.16 
 
 		 504 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  32.59 
 
 		 459 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 477 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  33.97 
 
 		 457 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.38 
 
 		 505 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 478 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 505 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  35.14 
 
 		 517 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 505 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>