More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1254 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  961    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  99.36 
 
 
471 aa  956    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  50.32 
 
 
478 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  50.32 
 
 
478 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  40.75 
 
 
449 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
458 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
449 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  35.36 
 
 
499 aa  240  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
450 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
450 aa  236  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  36.19 
 
 
472 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  32.13 
 
 
442 aa  229  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
433 aa  229  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  36.51 
 
 
519 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  36.34 
 
 
441 aa  227  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  31.78 
 
 
455 aa  225  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1941  histidine kinase  39.29 
 
 
514 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  30.97 
 
 
467 aa  224  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 
448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  35.86 
 
 
438 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  35.86 
 
 
438 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.61 
 
 
513 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  35.86 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  35.86 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  35.86 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  35.86 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  35.86 
 
 
438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
524 aa  220  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  36.53 
 
 
438 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
438 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  35.7 
 
 
438 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3989  sensor protein QseC  35 
 
 
452 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.302589  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  35.79 
 
 
501 aa  216  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02325  signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.280945  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  37.23 
 
 
444 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  35.85 
 
 
463 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  36 
 
 
438 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3012  histidine kinase  35.55 
 
 
475 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
454 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
461 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
462 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
455 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
455 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3266  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
433 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
454 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  32.4 
 
 
449 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4905  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
445 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  32.62 
 
 
459 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  32.62 
 
 
459 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
444 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72241  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  32.62 
 
 
459 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
448 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0700  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.03 
 
 
433 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  35.84 
 
 
457 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
515 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  32.62 
 
 
459 aa  206  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  32.76 
 
 
459 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  35.73 
 
 
455 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
519 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
517 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  34.18 
 
 
518 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  33.73 
 
 
457 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 
531 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  33.92 
 
 
523 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  32.3 
 
 
467 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  33.69 
 
 
526 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  32.69 
 
 
1093 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
458 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  34.74 
 
 
459 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.28 
 
 
505 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
480 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.28 
 
 
505 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  33.83 
 
 
817 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
515 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
453 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
458 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
515 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3681  hypothetical protein  31.68 
 
 
455 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.740643 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  31.59 
 
 
449 aa  202  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.28 
 
 
505 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.28 
 
 
505 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.25 
 
 
515 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4830  two-component regulatory system sensory histidine kinase  31.91 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00276208  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  33.5 
 
 
517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  31.37 
 
 
449 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  31.37 
 
 
449 aa  201  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
438 aa  201  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  31.37 
 
 
449 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3038  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
454 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
517 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  31.37 
 
 
449 aa  201  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  31.37 
 
 
449 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
517 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  35.55 
 
 
517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03385  sensor histidine kinase  32.8 
 
 
411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367883  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  34.77 
 
 
517 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1338  sensor histidine kinase  29.89 
 
 
452 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>