More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1184 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 480 aa  954    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.9 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2065  putative periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, QseC  54.68 
 
 		 467 aa  445  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278967 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6232  histidine kinase  47.26 
 
 		 459 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 455 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  38.92 
 
 		 455 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 455 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 		 458 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 458 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 450 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 458 aa  226  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 		 456 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 449 aa  219  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  39.58 
 
 		 438 aa  219  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  31.54 
 
 		 478 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  31.54 
 
 		 478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  33.91 
 
 		 441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  39.04 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  39.04 
 
 		 438 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  38.97 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  38.97 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  38.97 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  38.97 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  38.97 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  33.41 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 459 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 459 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 459 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 459 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  33.62 
 
 		 459 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  32.97 
 
 		 1093 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4905  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 455 aa  203  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  32.89 
 
 		 471 aa  203  6e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 450 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1893  sensor histidine kinase  31.46 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  32.63 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 445 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3512  sensor histidine kinase  30.6 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4242  ATP-binding region, ATPase-like  32.82 
 
 		 463 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2327  histidine kinase  30.62 
 
 		 467 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.205174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4358  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 446 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2623  histidine kinase  32.6 
 
 		 519 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0140  sensor histidine kinase  32.22 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 461 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 438 aa  190  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  39.38 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 462 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3911  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 468 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.697647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3301  histidine kinase  33.26 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3355  histidine kinase  28.75 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  35.35 
 
 		 501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02898  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with QseB  32.53 
 
 		 449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.760394  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0674  histidine kinase  32.53 
 
 		 449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3204  sensor protein QseC  32.53 
 
 		 449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02848  hypothetical protein  32.53 
 
 		 449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3315  sensor protein QseC  32.53 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0769555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  31.47 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3460  sensor protein QseC  32.31 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0671  sensor protein QseC  32.31 
 
 		 449 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4335  sensor protein QseC  32.53 
 
 		 449 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3491  sensor protein QseC  32.31 
 
 		 449 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00403  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.34 
 
 		 492 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00328679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  33.63 
 
 		 468 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  35.53 
 
 		 499 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 446 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 462 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1229  sensor histidine kinase  30.02 
 
 		 477 aa  176  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.131746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3005  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 443 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4040  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 443 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.45469 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 443 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.870976  normal  0.849775 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5498  two-component regulator system signal sensor kinase PmrB  33.4 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1338  sensor histidine kinase  31.55 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.117372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  37.5 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  35.62 
 
 		 518 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  33.52 
 
 		 463 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2297  sensor histidine kinase  31.13 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  35.62 
 
 		 817 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 450 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3821  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>