More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0970 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  87.91 
 
 
515 aa  851    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  96.53 
 
 
505 aa  959    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  85.66 
 
 
517 aa  850    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  80.76 
 
 
515 aa  805    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  96.53 
 
 
505 aa  958    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  80.16 
 
 
515 aa  803    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  85.19 
 
 
517 aa  855    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  100 
 
 
817 aa  1588    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  99.03 
 
 
518 aa  1013    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  85.33 
 
 
519 aa  845    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  85.52 
 
 
515 aa  865    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  95.11 
 
 
517 aa  920    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  79.48 
 
 
515 aa  793    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  96.72 
 
 
505 aa  961    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  96.53 
 
 
505 aa  959    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  99.04 
 
 
523 aa  1021    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  85 
 
 
517 aa  855    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  85 
 
 
517 aa  855    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.5 
 
 
524 aa  588  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  63.56 
 
 
517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  61.28 
 
 
526 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.28 
 
 
531 aa  555  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  58.58 
 
 
513 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  56.49 
 
 
509 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.44 
 
 
484 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.3 
 
 
487 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  53.15 
 
 
518 aa  432  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  49.67 
 
 
501 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.99 
 
 
482 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.22 
 
 
481 aa  422  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  50.97 
 
 
499 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  51.99 
 
 
481 aa  412  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  51.77 
 
 
481 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.77 
 
 
493 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  52.16 
 
 
500 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.3 
 
 
485 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  39.6 
 
 
463 aa  291  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  38.12 
 
 
462 aa  268  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  39.63 
 
 
506 aa  259  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
457 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
471 aa  253  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
452 aa  253  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  38.5 
 
 
439 aa  253  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
478 aa  252  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  38.97 
 
 
472 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
476 aa  249  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  37.88 
 
 
504 aa  249  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
463 aa  248  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  37.11 
 
 
469 aa  246  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
463 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  37.24 
 
 
474 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
501 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  38.86 
 
 
501 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  38.86 
 
 
501 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  38.86 
 
 
501 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
477 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  38.86 
 
 
501 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  38.86 
 
 
501 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
474 aa  244  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 
474 aa  244  5e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  39.08 
 
 
466 aa  243  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  37.93 
 
 
472 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  37.95 
 
 
496 aa  238  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  37.05 
 
 
467 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  39.6 
 
 
476 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
465 aa  233  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  36.7 
 
 
475 aa  232  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  37.13 
 
 
467 aa  230  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
480 aa  228  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  36.59 
 
 
480 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  36.92 
 
 
471 aa  223  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  36.47 
 
 
497 aa  223  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  35.45 
 
 
500 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 
469 aa  219  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  34.2 
 
 
495 aa  219  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  35.32 
 
 
474 aa  218  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
455 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
460 aa  217  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  35.57 
 
 
460 aa  217  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
462 aa  216  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 
459 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  34.71 
 
 
442 aa  216  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  35.33 
 
 
466 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  34.05 
 
 
483 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  36.91 
 
 
473 aa  214  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
463 aa  214  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  35.12 
 
 
460 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  34.15 
 
 
489 aa  213  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
459 aa  213  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.409159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  33.66 
 
 
542 aa  212  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
459 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
472 aa  213  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
494 aa  211  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
560 aa  211  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
494 aa  210  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
494 aa  210  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  33.56 
 
 
494 aa  210  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
494 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
459 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3255  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
494 aa  209  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>