More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2683 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  95.16 
 
 
517 aa  950    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  84.71 
 
 
505 aa  828    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  100 
 
 
517 aa  1027    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  93.23 
 
 
515 aa  935    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  87.32 
 
 
817 aa  858    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  82.33 
 
 
515 aa  817    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  84.71 
 
 
505 aa  828    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  94.99 
 
 
519 aa  949    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  84.51 
 
 
505 aa  827    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  94.97 
 
 
515 aa  976    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  82.42 
 
 
515 aa  814    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  87.98 
 
 
517 aa  854    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  99.61 
 
 
517 aa  1024    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  82.21 
 
 
515 aa  803    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  84.51 
 
 
505 aa  827    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  87.53 
 
 
518 aa  866    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  87.73 
 
 
523 aa  865    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  99.61 
 
 
517 aa  1024    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  63.48 
 
 
517 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.58 
 
 
524 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  59.64 
 
 
513 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.23 
 
 
531 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  61.59 
 
 
526 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  57.39 
 
 
509 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.22 
 
 
484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  54.23 
 
 
518 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  49.68 
 
 
501 aa  435  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.08 
 
 
487 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.81 
 
 
482 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.33 
 
 
481 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  50.42 
 
 
499 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  53.39 
 
 
500 aa  418  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  52.11 
 
 
481 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.19 
 
 
485 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.32 
 
 
493 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  53.32 
 
 
481 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  39.91 
 
 
463 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  37.58 
 
 
462 aa  276  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
452 aa  267  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  39.81 
 
 
439 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
463 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
477 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
463 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
474 aa  263  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
474 aa  263  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  38.77 
 
 
506 aa  262  8.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  38.12 
 
 
474 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  39.06 
 
 
504 aa  261  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  38.03 
 
 
469 aa  259  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
471 aa  258  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  39.67 
 
 
501 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  39.67 
 
 
501 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  39.67 
 
 
501 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  39.67 
 
 
501 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
501 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  39.67 
 
 
501 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
478 aa  258  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  37.89 
 
 
496 aa  256  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
476 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  38.13 
 
 
472 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  38.82 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  36.54 
 
 
467 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
457 aa  246  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  38.94 
 
 
466 aa  246  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  37.33 
 
 
475 aa  246  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
480 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  35.73 
 
 
480 aa  237  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  36.45 
 
 
467 aa  236  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  36.72 
 
 
500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  38.73 
 
 
476 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
465 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  36.94 
 
 
497 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  37.94 
 
 
471 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  36.12 
 
 
442 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
462 aa  231  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  34.67 
 
 
474 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  34.1 
 
 
495 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0209  sensor histidine kinase  33.4 
 
 
494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  34.81 
 
 
466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4079  sensor histidine kinase  33.4 
 
 
494 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3168  sensory transduction histidine kinase  37.38 
 
 
460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
469 aa  221  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  35.79 
 
 
508 aa  220  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2982  sensor histidine kinase  33.19 
 
 
488 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1620  sensor histidine kinase  33.19 
 
 
488 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3387  sensor histidine kinase  33.19 
 
 
488 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.31 
 
 
455 aa  219  7e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4005  sensor histidine kinase  33.19 
 
 
488 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
460 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
459 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  33.54 
 
 
489 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
463 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2923  sensor histidine kinase  33.55 
 
 
495 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
560 aa  217  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
494 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  34.12 
 
 
463 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
494 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  33.99 
 
 
483 aa  216  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
494 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
494 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>