More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3436 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  100 
 
 
497 aa  992    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  78.05 
 
 
495 aa  751    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  48.41 
 
 
500 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  45.95 
 
 
508 aa  344  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.35 
 
 
509 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  40.13 
 
 
496 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 
471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 
478 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
457 aa  256  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
474 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
463 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 
474 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  38.33 
 
 
472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  38.25 
 
 
474 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3333  histidine kinase  41.09 
 
 
468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
477 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  39.68 
 
 
501 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  39.68 
 
 
501 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  39.68 
 
 
501 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
501 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  39.68 
 
 
501 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  39.68 
 
 
501 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
476 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1451  histidine kinase  39.95 
 
 
440 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  39.04 
 
 
439 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  38.09 
 
 
504 aa  246  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2516  histidine kinase  37.32 
 
 
495 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142039  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  37.94 
 
 
472 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
462 aa  239  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35 
 
 
475 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  36.1 
 
 
489 aa  237  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  36.82 
 
 
463 aa  236  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3803  histidine kinase  36.02 
 
 
472 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.29901  normal  0.450405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
485 aa  233  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
517 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  35.42 
 
 
505 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  35.42 
 
 
505 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  35.42 
 
 
505 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  35.42 
 
 
505 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
515 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  35.33 
 
 
523 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  34.39 
 
 
467 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  35.33 
 
 
518 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  35.12 
 
 
517 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
517 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
517 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  35.76 
 
 
517 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  35.33 
 
 
817 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.78 
 
 
513 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
515 aa  227  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
515 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
479 aa  227  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
519 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
467 aa  223  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4039  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 
460 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
469 aa  221  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  35.28 
 
 
499 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  36.48 
 
 
474 aa  220  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.77 
 
 
515 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
515 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  35.2 
 
 
464 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  34.52 
 
 
473 aa  217  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  33.54 
 
 
526 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
462 aa  216  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0254  sensor kinase protein  37.34 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0041  sensor histidine kinase  37.34 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0041  sensor histidine kinase  37.34 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  33.69 
 
 
501 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2677  sensor histidine kinase  36.9 
 
 
459 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3275  sensor histidine kinase  36.9 
 
 
459 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1852  sensor histidine kinase  36.9 
 
 
459 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2700  sensor histidine kinase  36.9 
 
 
459 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
455 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
531 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2074  histidine kinase  35.43 
 
 
467 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.157607  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
477 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  36.18 
 
 
460 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3957  histidine kinase  34.29 
 
 
466 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
461 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0038  sensor histidine kinase  35.67 
 
 
459 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
465 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  36.53 
 
 
460 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 
459 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  38.43 
 
 
471 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
463 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0023  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
455 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
455 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  35.61 
 
 
473 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  34.3 
 
 
464 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
459 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.32 
 
 
509 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  34.32 
 
 
483 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0031  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
455 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0039  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
455 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  32.32 
 
 
518 aa  204  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  36.02 
 
 
506 aa  202  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  35.87 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  35.73 
 
 
460 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>