More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0358 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.92 
 
 		 485 aa  711    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  81.08 
 
 		 481 aa  746    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  70.68 
 
 		 481 aa  648    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  76.16 
 
 		 500 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 482 aa  954    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  72.06 
 
 		 484 aa  687    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  80.87 
 
 		 493 aa  746    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  66.88 
 
 		 487 aa  606  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.42 
 
 		 481 aa  592  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  60.49 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  56.56 
 
 		 518 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  54.94 
 
 		 526 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.2 
 
 		 531 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  53.99 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.91 
 
 		 524 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  55.25 
 
 		 517 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.32 
 
 		 515 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.1 
 
 		 515 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.8 
 
 		 519 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.25 
 
 		 515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.93 
 
 		 517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.73 
 
 		 515 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  53.44 
 
 		 517 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  54.77 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  52.99 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  52.99 
 
 		 817 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  52.77 
 
 		 523 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.81 
 
 		 517 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  53.81 
 
 		 517 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.81 
 
 		 517 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  51.44 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  51.44 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  51.44 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  51.44 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  48.34 
 
 		 501 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  49.56 
 
 		 499 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  38.63 
 
 		 463 aa  263  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  37.61 
 
 		 496 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  37.72 
 
 		 506 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  37.89 
 
 		 472 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 478 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  39.39 
 
 		 439 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  36.61 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 462 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  39.03 
 
 		 466 aa  224  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  37.79 
 
 		 504 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 455 aa  223  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  38.12 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  38.12 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  38.12 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  38.12 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  38.12 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 463 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 463 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  37.88 
 
 		 476 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  38.22 
 
 		 471 aa  217  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.26 
 
 		 475 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 		 462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 		 477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  35.64 
 
 		 480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 		 480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  34.69 
 
 		 467 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 474 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 474 aa  213  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  36.32 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  36.57 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 463 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 542 aa  209  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 560 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  34.11 
 
 		 474 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 465 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 460 aa  205  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3387  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 488 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1620  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 488 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2982  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 488 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 465 aa  202  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3168  sensory transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 460 aa  202  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0209  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 494 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  35.34 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 		 494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2923  sensor histidine kinase  33.61 
 
 		 495 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  33.4 
 
 		 494 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4079  sensor histidine kinase  33.05 
 
 		 494 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 445 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4005  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 488 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 494 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  32.77 
 
 		 495 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 479 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3925  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.306809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>