More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5198 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.56 
 
 		 493 aa  649    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  69.33 
 
 		 500 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  66.32 
 
 		 484 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  70.77 
 
 		 481 aa  650    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  100 
 
 		 481 aa  959    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.68 
 
 		 482 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  70.39 
 
 		 485 aa  632  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.83 
 
 		 487 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.03 
 
 		 481 aa  547  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  56.03 
 
 		 509 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  52.76 
 
 		 518 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  51.98 
 
 		 526 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.35 
 
 		 531 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  53.43 
 
 		 513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  52.8 
 
 		 517 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.24 
 
 		 524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.88 
 
 		 519 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.22 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.11 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.07 
 
 		 517 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  51.99 
 
 		 817 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  51.99 
 
 		 518 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  51.66 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  51.77 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.11 
 
 		 517 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51 
 
 		 515 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  52.11 
 
 		 517 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.11 
 
 		 517 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.33 
 
 		 515 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  50.55 
 
 		 515 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  51.32 
 
 		 499 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  50.22 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  50.22 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  50.22 
 
 		 505 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  50.22 
 
 		 505 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  45.92 
 
 		 501 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  37.87 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  36.44 
 
 		 463 aa  246  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  36.75 
 
 		 506 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  38.1 
 
 		 439 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  35.56 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  33.61 
 
 		 462 aa  228  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  34.97 
 
 		 472 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 463 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 463 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 455 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 459 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 477 aa  217  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 457 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.71 
 
 		 475 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 463 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  37.53 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  35.97 
 
 		 474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 474 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 474 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  34.33 
 
 		 467 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  34.17 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  32.38 
 
 		 542 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  35.48 
 
 		 504 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  37.07 
 
 		 476 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  35.19 
 
 		 478 aa  209  8e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 501 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  35.19 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  35.58 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  35.58 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  35.58 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  35.58 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 459 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  35.58 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  35.63 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  34.05 
 
 		 473 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 471 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 465 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  35.77 
 
 		 459 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3168  sensory transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 460 aa  206  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 560 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  35.77 
 
 		 459 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 459 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 459 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 459 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 480 aa  203  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 460 aa  202  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  35.07 
 
 		 449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  35.6 
 
 		 467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  35.73 
 
 		 1093 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  34.4 
 
 		 460 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  33.99 
 
 		 466 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  34.17 
 
 		 460 aa  196  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 461 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 465 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 472 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 477 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  32.7 
 
 		 489 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>