More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0464 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  73.75 
 
 
513 aa  751    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  84.67 
 
 
517 aa  857    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.33 
 
 
531 aa  751    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
524 aa  1053    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  72.61 
 
 
526 aa  748    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.95 
 
 
515 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  64.54 
 
 
515 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.36 
 
 
515 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  63.99 
 
 
517 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  63.09 
 
 
518 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.56 
 
 
515 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  64.19 
 
 
817 aa  585  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  63.09 
 
 
523 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.92 
 
 
517 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.48 
 
 
515 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.58 
 
 
517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.45 
 
 
519 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  61.58 
 
 
517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  61.58 
 
 
517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  62.92 
 
 
505 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  62.92 
 
 
505 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  62.92 
 
 
505 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  62.92 
 
 
505 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  56.9 
 
 
509 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.58 
 
 
481 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.84 
 
 
484 aa  465  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  54.11 
 
 
487 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  55.1 
 
 
500 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  54.82 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.82 
 
 
493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  52.05 
 
 
518 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.91 
 
 
482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  50 
 
 
501 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.37 
 
 
485 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  52.24 
 
 
481 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  49.77 
 
 
499 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  40.8 
 
 
463 aa  303  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  39.42 
 
 
466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  37 
 
 
462 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  39.12 
 
 
469 aa  266  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  37.33 
 
 
496 aa  263  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
463 aa  262  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  39.64 
 
 
474 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.05 
 
 
477 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
474 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
474 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.95 
 
 
463 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  37.04 
 
 
506 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  38.57 
 
 
439 aa  257  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
460 aa  256  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  36.54 
 
 
483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3604  histidine kinase  36.76 
 
 
483 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  38.53 
 
 
504 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  36.57 
 
 
467 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
471 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  39.14 
 
 
501 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  39.14 
 
 
501 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  39.14 
 
 
501 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  39.14 
 
 
501 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  39.14 
 
 
501 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  39.14 
 
 
501 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.92 
 
 
476 aa  249  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  38.37 
 
 
472 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  36.75 
 
 
474 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  38.06 
 
 
467 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
452 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
478 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  38.44 
 
 
472 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
457 aa  242  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
465 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
459 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  35.36 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  34.22 
 
 
466 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  36.62 
 
 
471 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
480 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  34.24 
 
 
542 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
459 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35.58 
 
 
475 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
463 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  37.88 
 
 
476 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.7 
 
 
455 aa  229  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  34.99 
 
 
460 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
459 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
456 aa  226  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
472 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  36.97 
 
 
460 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
433 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
560 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  37.5 
 
 
471 aa  220  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  34.13 
 
 
489 aa  219  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
461 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  33.54 
 
 
463 aa  219  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  35.74 
 
 
480 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4039  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
460 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  37.2 
 
 
471 aa  218  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  35.63 
 
 
473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
455 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
455 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
479 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.3868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>