More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0438 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  81.1 
 
 
523 aa  796    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  78.86 
 
 
505 aa  765    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  78.86 
 
 
505 aa  766    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
515 aa  1026    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  83.37 
 
 
515 aa  800    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  81.1 
 
 
817 aa  796    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  82.33 
 
 
517 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  81.54 
 
 
519 aa  797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  78.66 
 
 
505 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  82.13 
 
 
515 aa  810    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  82.73 
 
 
517 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  81.37 
 
 
517 aa  789    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  81.87 
 
 
517 aa  800    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  90.49 
 
 
515 aa  928    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  89.71 
 
 
515 aa  920    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  78.66 
 
 
505 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  80.89 
 
 
518 aa  796    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  82.73 
 
 
517 aa  805    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.36 
 
 
524 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  63.42 
 
 
517 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  62.77 
 
 
526 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.55 
 
 
531 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  60.12 
 
 
513 aa  567  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.56 
 
 
484 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  55.11 
 
 
509 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.32 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  47.63 
 
 
501 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  51.35 
 
 
518 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  53.88 
 
 
500 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.63 
 
 
487 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.1 
 
 
493 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  54.1 
 
 
481 aa  428  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.79 
 
 
481 aa  428  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  51.22 
 
 
481 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.41 
 
 
485 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  49.35 
 
 
499 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  39.51 
 
 
463 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  36.73 
 
 
462 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  39.33 
 
 
469 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  38.26 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
452 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 
471 aa  253  6e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  38.11 
 
 
472 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  38.23 
 
 
474 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
501 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
463 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
474 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  38.86 
 
 
501 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  38.86 
 
 
501 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
477 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  38.86 
 
 
501 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  38.86 
 
 
501 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  38.86 
 
 
501 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
474 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  39.13 
 
 
466 aa  249  9e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  37.41 
 
 
506 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 
463 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  38.41 
 
 
472 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
457 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  36.88 
 
 
439 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
476 aa  242  9e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  37.22 
 
 
496 aa  242  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  36.17 
 
 
475 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.03 
 
 
478 aa  239  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  37 
 
 
467 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 
480 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
465 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  36.67 
 
 
467 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  38.24 
 
 
476 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
460 aa  226  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  35.47 
 
 
442 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
560 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  36.69 
 
 
497 aa  224  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  34.19 
 
 
466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  35.89 
 
 
500 aa  220  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
455 aa  220  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  35.6 
 
 
480 aa  220  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  34.91 
 
 
495 aa  219  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  36.48 
 
 
471 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  32.61 
 
 
542 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
479 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292807  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  33.4 
 
 
474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
494 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
494 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3168  sensory transduction histidine kinase  35.88 
 
 
460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2982  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
488 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3387  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
488 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1620  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
488 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
493 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  33.19 
 
 
483 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
472 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4005  sensor histidine kinase  32.89 
 
 
488 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0209  sensor histidine kinase  32.59 
 
 
494 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4079  sensor histidine kinase  32.59 
 
 
494 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
459 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
494 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  32.66 
 
 
494 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3340  sensor histidine kinase  33.11 
 
 
495 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
494 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>