More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6141 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  81.33 
 
 		 476 aa  675    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 479 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2263  histidine kinase  45.36 
 
 		 477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043312 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  38.9 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 531 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.37 
 
 		 513 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 		 515 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  37.42 
 
 		 500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  38.35 
 
 		 526 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 515 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  37.87 
 
 		 523 aa  233  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  37.66 
 
 		 518 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 515 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  41.41 
 
 		 517 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.82 
 
 		 515 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  37.5 
 
 		 467 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  37.66 
 
 		 817 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 524 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  39.91 
 
 		 504 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 519 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  38.37 
 
 		 474 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 515 aa  230  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 474 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 474 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  37.5 
 
 		 517 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 457 aa  229  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  37.39 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  37.39 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  37.39 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  37.18 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  37.92 
 
 		 499 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 		 471 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 		 517 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  37.53 
 
 		 460 aa  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  39.9 
 
 		 501 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  39.9 
 
 		 501 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  39.9 
 
 		 501 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  39.9 
 
 		 501 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  39.9 
 
 		 501 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  39.9 
 
 		 501 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 463 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 517 aa  223  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 517 aa  223  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  37.55 
 
 		 517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 481 aa  221  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  38.39 
 
 		 472 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 476 aa  220  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  36.6 
 
 		 508 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  37.83 
 
 		 481 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 478 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 		 493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  36.99 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  36.55 
 
 		 481 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  37.79 
 
 		 439 aa  210  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 484 aa  208  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  36.09 
 
 		 495 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  36.21 
 
 		 518 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  38.19 
 
 		 506 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 482 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0311  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.19 
 
 		 476 aa  206  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  37.33 
 
 		 496 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  36.62 
 
 		 467 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.43 
 
 		 509 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  35.78 
 
 		 500 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 465 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  35.75 
 
 		 497 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 469 aa  195  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  38.48 
 
 		 471 aa  192  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 485 aa  192  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  33.56 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  34.95 
 
 		 474 aa  187  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  32.7 
 
 		 462 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 480 aa  186  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  34.93 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  34.28 
 
 		 469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  33.63 
 
 		 460 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  32.84 
 
 		 463 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 462 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 459 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  33.56 
 
 		 460 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 455 aa  179  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  37.43 
 
 		 441 aa  179  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  35.58 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 461 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  33.43 
 
 		 471 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  33.43 
 
 		 471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  33.33 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3229  histidine kinase  34.22 
 
 		 557 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 472 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  33.1 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  32.55 
 
 		 542 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>