More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0953 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  100 
 
 
501 aa  968    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.43 
 
 
476 aa  674    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  80.27 
 
 
463 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  79.82 
 
 
463 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  100 
 
 
501 aa  968    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  100 
 
 
501 aa  968    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  79.12 
 
 
477 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  91.09 
 
 
504 aa  841    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  78.06 
 
 
474 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  100 
 
 
501 aa  968    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  100 
 
 
501 aa  968    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  77.43 
 
 
474 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  99.8 
 
 
501 aa  964    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  77.43 
 
 
474 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  73.25 
 
 
472 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  61.21 
 
 
472 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.39 
 
 
478 aa  458  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  58.37 
 
 
439 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  58.41 
 
 
471 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  40.32 
 
 
496 aa  285  9e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
515 aa  276  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 
515 aa  272  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
519 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  36.76 
 
 
501 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
517 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.31 
 
 
513 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
524 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  37.89 
 
 
505 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  37.89 
 
 
505 aa  264  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  38.62 
 
 
517 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  38.31 
 
 
523 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  38.08 
 
 
518 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
515 aa  263  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  39.82 
 
 
474 aa  262  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  37.67 
 
 
505 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  37.67 
 
 
505 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
517 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  38.31 
 
 
817 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
517 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  38.15 
 
 
500 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  38.22 
 
 
517 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  37.19 
 
 
526 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
531 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  37.33 
 
 
463 aa  260  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
515 aa  259  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.89 
 
 
515 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  35.97 
 
 
489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  39.37 
 
 
517 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
462 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  38.67 
 
 
497 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  38.78 
 
 
495 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  36.56 
 
 
466 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  37.15 
 
 
508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
509 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  37.77 
 
 
467 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
459 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
459 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
463 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  35.67 
 
 
499 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
457 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
484 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 
481 aa  238  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.12 
 
 
465 aa  237  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 
464 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  36.05 
 
 
475 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
461 aa  236  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
472 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  37.38 
 
 
460 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
487 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
469 aa  233  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  37.38 
 
 
460 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  37.44 
 
 
460 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
459 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  38.69 
 
 
460 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
493 aa  230  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  36.68 
 
 
506 aa  230  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  37.28 
 
 
481 aa  229  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  37.21 
 
 
460 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  35.33 
 
 
518 aa  228  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  36.32 
 
 
463 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3333  histidine kinase  37.5 
 
 
468 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.5 
 
 
509 aa  223  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  34.81 
 
 
469 aa  223  9e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  38.03 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 
485 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
482 aa  220  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
465 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  36.03 
 
 
500 aa  220  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  37.94 
 
 
473 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
479 aa  219  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292807  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
480 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  35.94 
 
 
481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  38.6 
 
 
476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4763  two-component sensor  39.52 
 
 
460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0311  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  32.21 
 
 
462 aa  211  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  36.89 
 
 
464 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2516  histidine kinase  32.76 
 
 
495 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142039  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>