More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2406 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  82.5 
 
 
517 aa  816    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  99.6 
 
 
505 aa  996    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.37 
 
 
515 aa  776    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  82.31 
 
 
517 aa  815    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.36 
 
 
515 aa  771    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  96.33 
 
 
523 aa  951    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  96.53 
 
 
817 aa  955    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  83.01 
 
 
515 aa  831    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  100 
 
 
505 aa  999    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  92.06 
 
 
517 aa  879    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  82.95 
 
 
517 aa  815    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  99.8 
 
 
505 aa  997    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  77.69 
 
 
515 aa  767    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  82.63 
 
 
519 aa  810    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.63 
 
 
515 aa  809    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  95.95 
 
 
518 aa  945    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  100 
 
 
505 aa  999    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  82.31 
 
 
517 aa  815    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.27 
 
 
524 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  62.29 
 
 
517 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  60 
 
 
526 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60 
 
 
531 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  57.59 
 
 
513 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  47.93 
 
 
501 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  54.76 
 
 
509 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.55 
 
 
484 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  52.28 
 
 
518 aa  422  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 
487 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  50.22 
 
 
499 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.68 
 
 
481 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.44 
 
 
482 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.2 
 
 
485 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  51.32 
 
 
481 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.32 
 
 
493 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  50.22 
 
 
481 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  50.43 
 
 
500 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  39.19 
 
 
463 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  37.89 
 
 
462 aa  266  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
471 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  37.7 
 
 
469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  38.11 
 
 
506 aa  253  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
463 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  37.88 
 
 
504 aa  252  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
457 aa  252  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
478 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
452 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  37.88 
 
 
439 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
463 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 
501 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  38.42 
 
 
501 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  38.42 
 
 
501 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  38.42 
 
 
501 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  38.42 
 
 
501 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  38.42 
 
 
501 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
477 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  36.77 
 
 
474 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  38.12 
 
 
472 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
476 aa  247  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  36.99 
 
 
467 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
474 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
474 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  38.12 
 
 
466 aa  243  6e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 
465 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  37.41 
 
 
472 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  37.28 
 
 
496 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  38.89 
 
 
476 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  37.01 
 
 
467 aa  233  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  36.57 
 
 
497 aa  229  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
460 aa  226  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35.9 
 
 
475 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  35.7 
 
 
480 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  33.7 
 
 
495 aa  224  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2385  histidine kinase  34.73 
 
 
442 aa  223  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247211  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
469 aa  223  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  34.94 
 
 
500 aa  223  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  36.77 
 
 
471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  36.73 
 
 
473 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  32.78 
 
 
483 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  33.6 
 
 
542 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.409159 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  33.47 
 
 
489 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
494 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  34.37 
 
 
474 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0042  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
482 aa  213  9e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  34.83 
 
 
460 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 
494 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
459 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
494 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3255  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
494 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  32.91 
 
 
494 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3168  sensory transduction histidine kinase  36.32 
 
 
460 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
494 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
458 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
560 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
463 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
479 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292807  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  34.38 
 
 
460 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
493 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>