More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3536 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  81.07 
 
 		 542 aa  841    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 560 aa  1116    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3229  histidine kinase  54.83 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3553  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.64 
 
 		 557 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0007  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  46.79 
 
 		 494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 494 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.79 
 
 		 494 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3340  sensor histidine kinase  46.32 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4005  sensor histidine kinase  46.6 
 
 		 488 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.83 
 
 		 494 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3255  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.99 
 
 		 494 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3925  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.306809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4079  sensor histidine kinase  46.6 
 
 		 494 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1620  sensor histidine kinase  46.17 
 
 		 488 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2982  sensor histidine kinase  46.17 
 
 		 488 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3387  sensor histidine kinase  46.17 
 
 		 488 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0209  sensor histidine kinase  46.38 
 
 		 494 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2923  sensor histidine kinase  46.07 
 
 		 495 aa  346  8e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3058  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.91 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.29 
 
 		 493 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  34.9 
 
 		 517 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 531 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.34 
 
 		 509 aa  231  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  32.31 
 
 		 526 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 487 aa  230  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.13 
 
 		 513 aa  228  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 517 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 519 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 524 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  32.02 
 
 		 501 aa  226  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  33.13 
 
 		 499 aa  225  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 515 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  33.75 
 
 		 463 aa  224  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  34.19 
 
 		 517 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  35.15 
 
 		 817 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.75 
 
 		 515 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  34.71 
 
 		 523 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  35.05 
 
 		 518 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 515 aa  220  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 469 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 505 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 481 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 505 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 505 aa  217  4e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 505 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  34.38 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  35.79 
 
 		 506 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 484 aa  211  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 482 aa  209  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  32.64 
 
 		 481 aa  208  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 485 aa  208  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  32.19 
 
 		 481 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.26 
 
 		 475 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  31.24 
 
 		 462 aa  204  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 478 aa  203  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  34.85 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 455 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 459 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  32.43 
 
 		 466 aa  193  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  31.93 
 
 		 480 aa  192  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  31.64 
 
 		 518 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 463 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 459 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  39.45 
 
 		 438 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  39.45 
 
 		 438 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  39.45 
 
 		 438 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  39.45 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  39.45 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  39.45 
 
 		 438 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  39.45 
 
 		 438 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  39.76 
 
 		 438 aa  187  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  33.33 
 
 		 439 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  38.56 
 
 		 441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  30.2 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  40.6 
 
 		 438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 		 445 aa  183  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 461 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  31.76 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  33.06 
 
 		 460 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  33.19 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  31.51 
 
 		 467 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  32.9 
 
 		 460 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 459 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.409159 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  31.25 
 
 		 496 aa  180  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 472 aa  179  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  31.08 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 480 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>