More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4230 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  85.34 
 
 		 463 aa  732    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.03 
 
 		 459 aa  714    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  100 
 
 		 460 aa  922    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  85.12 
 
 		 459 aa  730    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  97.61 
 
 		 460 aa  838    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  85.93 
 
 		 461 aa  731    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  84.68 
 
 		 459 aa  726    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  76.62 
 
 		 460 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  67.54 
 
 		 474 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4763  two-component sensor  75.58 
 
 		 460 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  71.53 
 
 		 465 aa  569  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 472 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  39 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  42.36 
 
 		 463 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  40.04 
 
 		 466 aa  290  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  40.63 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  36.65 
 
 		 489 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2980  tricarboxylic transport regulatory protein  37.53 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.675571 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2896  tricarboxylic transport: regulatory protein  37.53 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2963  tricarboxylic transport: regulatory protein  37.53 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  36.57 
 
 		 472 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3083  tricarboxylic transporter regulatory protein  37.53 
 
 		 471 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  38.01 
 
 		 463 aa  253  7e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2927  tricarboxylic transport: regulatory protein  37.3 
 
 		 471 aa  252  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  36.92 
 
 		 499 aa  247  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 476 aa  247  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  36.82 
 
 		 501 aa  246  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 471 aa  246  8e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 524 aa  246  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  36.9 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  36.71 
 
 		 500 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 531 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 477 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 463 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 463 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  37.94 
 
 		 504 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  36.22 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  38.7 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  37.55 
 
 		 508 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.47 
 
 		 509 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 465 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.75 
 
 		 513 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  36.49 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  37.65 
 
 		 501 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  37.65 
 
 		 501 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  37.65 
 
 		 501 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 501 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  37.65 
 
 		 501 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  38.43 
 
 		 467 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  37.65 
 
 		 501 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  35.57 
 
 		 517 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  37.53 
 
 		 439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 469 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  35.33 
 
 		 523 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  35.33 
 
 		 517 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  38.06 
 
 		 471 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  35.33 
 
 		 817 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 479 aa  232  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  35.12 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 517 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.7 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 515 aa  227  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 515 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 515 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.84 
 
 		 505 aa  226  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 519 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 485 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  35.96 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 505 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 505 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  35.54 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 505 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  34.92 
 
 		 460 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 464 aa  221  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3957  histidine kinase  34.44 
 
 		 466 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0258  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 457 aa  219  6e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.818246  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  35.27 
 
 		 518 aa  219  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0287  two-component system, sensor protein  36.7 
 
 		 457 aa  219  7e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  34.04 
 
 		 517 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 481 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 515 aa  216  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 462 aa  216  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 		 460 aa  216  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2516  histidine kinase  33.55 
 
 		 495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0058  histidine kinase  37.09 
 
 		 461 aa  213  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3282  histidine kinase  36.06 
 
 		 483 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 463 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  34.17 
 
 		 495 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  36.4 
 
 		 466 aa  209  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 493 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  34.33 
 
 		 481 aa  209  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  35.04 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>