More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3342 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3342  histidine kinase  100 
 
 		 460 aa  907    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0710689 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3644  histidine kinase  95.43 
 
 		 460 aa  842    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  72.37 
 
 		 464 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.093144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  70.31 
 
 		 467 aa  592  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0311  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.13 
 
 		 476 aa  468  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 478 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 474 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 474 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 476 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  40.14 
 
 		 476 aa  249  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 477 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  36.94 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  38.99 
 
 		 472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  36.85 
 
 		 472 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 471 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 463 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  37.35 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  33.55 
 
 		 501 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 501 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  37.62 
 
 		 501 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  37.62 
 
 		 501 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  37.62 
 
 		 501 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  37.62 
 
 		 501 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  37.62 
 
 		 501 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  35.85 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 463 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  37.17 
 
 		 496 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 484 aa  223  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 460 aa  223  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  34.72 
 
 		 467 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  36.22 
 
 		 460 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  34.98 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  33.62 
 
 		 499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  36.51 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.41 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 531 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  34.42 
 
 		 463 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54500  two-component sensor  36.38 
 
 		 460 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.452392 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 481 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  35.54 
 
 		 460 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  37.75 
 
 		 471 aa  210  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  32.88 
 
 		 526 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  32.98 
 
 		 489 aa  209  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 515 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.47 
 
 		 475 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 519 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 462 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 479 aa  206  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.97 
 
 		 515 aa  206  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  32.44 
 
 		 517 aa  206  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 517 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  33.12 
 
 		 495 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  35.86 
 
 		 497 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  33.83 
 
 		 481 aa  204  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 493 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  32.96 
 
 		 518 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  32.74 
 
 		 523 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 515 aa  203  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 524 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  32.82 
 
 		 817 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 479 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  34.25 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 515 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  31.06 
 
 		 463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0058  histidine kinase  34.06 
 
 		 461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 505 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 465 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  33.48 
 
 		 473 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  32.52 
 
 		 462 aa  196  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 509 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  32.06 
 
 		 517 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 515 aa  196  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  33.64 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 517 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 517 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.02 
 
 		 509 aa  195  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  32.58 
 
 		 518 aa  194  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  35.19 
 
 		 508 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2263  histidine kinase  36.38 
 
 		 477 aa  193  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043312 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  33.41 
 
 		 464 aa  193  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3339  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 472 aa  192  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.184807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0728  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 467 aa  190  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  34.06 
 
 		 500 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 469 aa  190  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4763  two-component sensor  35.93 
 
 		 460 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3012  histidine kinase  31.94 
 
 		 473 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.250655  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  33.19 
 
 		 481 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 485 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>